關(guān)于構(gòu)象轉(zhuǎn)化,ECD
我一般是先花chemdraw2D結(jié)構(gòu),然后用chemdraw3D打開(kāi)(這時(shí)候可能需要小小調(diào)整),然后通過(guò)openbabel中的confab進(jìn)行xyz左邊轉(zhuǎn)換,這時(shí)候可能搜索不到構(gòu)象,也可能一個(gè),多個(gè)構(gòu)象(麻煩解釋下構(gòu)象數(shù)目問(wèn)題)。我自己做了一個(gè)化合物和它對(duì)映異構(gòu)體的ECD,發(fā)展結(jié)果是一樣的,是我做錯(cuò)了嗎?
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
輸入的坐標(biāo)明明不一樣,得到的ECD卻一樣
這是一個(gè)化合物的輸入文件,大佬幫忙看一下哪里出錯(cuò)了嗎?
把你的原始的兩個(gè)構(gòu)象的輸入文件都發(fā)上來(lái)看看,F(xiàn)在附件系統(tǒng)用不了。放在網(wǎng)盤(pán)里。分享鏈接就可以。
對(duì)映體ECD應(yīng)該鏡像對(duì)稱,可能是構(gòu)象搜索問(wèn)題。百度搜索【微信學(xué)術(shù)交流群】進(jìn)群?jiǎn)枂?wèn)吧。或者搜索【構(gòu)象搜索教程 小分子構(gòu)象搜索】。有三種搜索方式,針對(duì)不同類型的結(jié)構(gòu),