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小千100新蟲 (小有名氣)
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[求助]
同源重組多片段連接做不出來,我想重新做但又不知道是哪里操作的問題,怎么改進(jìn)? 已有3人參與
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使用的是諾維贊多片段連接試劑盒,引物用公司的在線軟件設(shè)計的。載體8000多bp,三個片段分別1019,381,250多。 1.載體用takara快切酶雙酶切30min,切膠回收,目的片段分別以之前的2個T載體擴(kuò)增,一個質(zhì)粒擴(kuò)增,切膠回收。 2.分別稀釋跑膠估算載體、三個片段濃度,按片段長度計算大致每個片段需要多少ng,加入多少μl 3.按說明書分別加入4μl載體,三個片段2μl,1μl,1μl,酶和buffer分別2μl,4μl,總體積20μl。37度反應(yīng)30min。 4.10μl重組產(chǎn)物轉(zhuǎn)化100μl大腸桿菌感受態(tài),過夜培養(yǎng)挑單菌落(比較少) 5.挑了9個單菌落搖菌提了質(zhì)粒,雙酶切都沒有切出片段。 6.同時我做了兩個陰性對照1和2,都長了很多單菌落。1是只加了載體4μl,加水至20μl.2是只加了三個片段,加水至20μl. @wizardfan @youlinglyw @biostar2009 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
至尊木蟲 (著名寫手)
用戶注銷 (正式寫手)
木蟲 (著名寫手)
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你是要做原核菌的同源重組嗎?我這兩天也剛查這方面的資料,簡單說一下我的見解,僅供交流。 三片段各自擴(kuò)增好后,先進(jìn)行連接,然后再把融合好的打靶片段通過TA克隆鏈接到載體上,轉(zhuǎn)入目的菌后進(jìn)行篩選就可以。 大體流程是這樣,說著不難,但確實(shí)是做的過程中會有很多問題。 你上面提到的疑惑,多片段和載體共同連接轉(zhuǎn)化后,沒什么單菌落,那可能是連接效率不太好。 另外,你挑了單克隆搖菌提質(zhì)粒,再雙酶切,是什么目的呢?連上了為什么又要切開? 最后,你所謂的陰性對照1只加了載體,你指的是線性化的載體嗎?那不應(yīng)該會長菌啊。如果是空載,是會有正常菌落的。 陰性對照2是加入了三個基因片段,理論上也不會長菌啊,為什么你的也有呢? |

新蟲 (小有名氣)
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謝謝你的解答。后面我咨詢了技術(shù),說可能是原本我的載體就沒有切開,陰性對照加入片段長菌的可能是其中一個片段擴(kuò)增用的模板殘留,這個模板質(zhì)粒含有同樣的抗性,其實(shí)我也不清楚,后面我重新酶切了載體,重新操作了一遍,連接成功了,也是神奇 ![]() 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
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嗯嗯,也有同學(xué)推薦我那么做,后面我重新這樣操作連接成功了。陰性對照1是只加了線性化載體,長單菌落可能是我沒有切開;陰性對照2只加片段長菌可能是我其中一個片段用的擴(kuò)增模板殘留了,那個質(zhì)粒模板具有相同抗性。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
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是的,我覺得有時候碰運(yùn)氣,后面我重復(fù)了就連成了,具體哪里問題我也不清楚。還有一個問題就是我其中一個酶切位點(diǎn)上下游GC含量偏低,沒達(dá)到說明書中的40%-60%之間。這個應(yīng)該也是一個因素影響連接效率,總之嚴(yán)格按說明書的來應(yīng)該不會錯的。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
用戶注銷 (正式寫手)
新蟲 (著名寫手)
您好,我也用的諾唯贊的酶,同時試了單片段連接和多片段連接,不管我換哪個感受態(tài)細(xì)胞,不管我加多少,都不長菌![]() ,求大神指教發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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