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Inverse—PCR 已有1人參與
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之前實(shí)驗(yàn)室一直用inversespcr定位外緣插入片段,我們是做植物,最近一個(gè)月,一直做不出來(lái),跑膠全是空白,酶以及其他試劑幾乎換了個(gè)遍,就是不行,大家有沒有遇到類似情況,求助! @wizardfan @biostar2009 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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接上一條, 你可以考慮用什么long pcr kit(長(zhǎng)鏈pcr的工具), 可能成功率會(huì)高點(diǎn), 也只是說(shuō)成功率高點(diǎn):不能保證成功。 |
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首先 這類實(shí)驗(yàn)?zāi)阋欢ㄒ_定不是技術(shù)問題, 最好的方法是 你找個(gè)做過inverse pcr的人帶你做 我以前也是做一個(gè)月做不出來(lái) 后來(lái)發(fā)現(xiàn)是酶壞了(被師弟放在室溫下太久了,變質(zhì)了)。 后來(lái)發(fā)現(xiàn)pcr cycles溫度不太對(duì)(92-55-72)。 后來(lái)發(fā)現(xiàn)跑膠的染料變質(zhì),染不上去。 最后找個(gè)分子生物學(xué)專家?guī)兔Σ彭樌鉀Q。 你一定要找個(gè)曾經(jīng)成功過的人帶你,而且要先確認(rèn)你的所有材料都是好的,技術(shù)環(huán)節(jié)不出錯(cuò) 其次 即使技術(shù)環(huán)節(jié)不出錯(cuò), inverse pcr這個(gè)技術(shù)本身, 也未必可以成功。 這個(gè)純粹看運(yùn)氣, 你定位插入的地方, 如果距離切割(限制性內(nèi)切酶)的地方太遠(yuǎn), 比如2w個(gè)base pairs(有點(diǎn)夸張的比喻), 那你肯定pcr不成。 這種情況要做full genome sequence,燒錢是唯一的辦法。 |
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首先 這類實(shí)驗(yàn)?zāi)阋欢ㄒ_定不是技術(shù)問題, 最好的方法是 你找個(gè)做過inverse pcr的人帶你做 我以前也是做一個(gè)月做不出來(lái) 后來(lái)發(fā)現(xiàn)是酶壞了(被師弟放在室溫下太久了,變質(zhì)了)。 后來(lái)發(fā)現(xiàn)pcr cycles溫度不太對(duì)(92-55-72)。 后來(lái)發(fā)現(xiàn)跑膠的染料變質(zhì),染不上去。 最后找個(gè)分子生物學(xué)專家?guī)兔Σ彭樌鉀Q。 你一定要找個(gè)曾經(jīng)成功過的人帶你,而且要先確認(rèn)你的所有材料都是好的,技術(shù)環(huán)節(jié)不出錯(cuò) 其次 即使技術(shù)環(huán)節(jié)不出錯(cuò), inverse pcr這個(gè)技術(shù)本身, 也未必可以成功。 這個(gè)純粹看運(yùn)氣, 你定位插入的地方, 如果距離切割(限制性內(nèi)切酶)的地方太遠(yuǎn), 比如2w個(gè)base pairs(有點(diǎn)夸張的比喻), 那你肯定pcr不成。 這種情況要做full genome sequence,燒錢是唯一的辦法。 |
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謝謝回答,不是很會(huì)用小木蟲,抱歉才看到,整個(gè)體系之前實(shí)驗(yàn)室做了一年,非常成熟,師兄帶我做的,后來(lái)師兄畢業(yè)了,我們是做很多獨(dú)立樣品,而且是四堿基酶,所以做一次二十多個(gè)樣品,如果成功的話不會(huì)一個(gè)也做不出來(lái),各種試劑沒有問題,酶和引物都用新的,循環(huán)我也用的55度,我還會(huì)進(jìn)行二次循環(huán),用58度,最近一直在做,還是不行,有點(diǎn)氣餒了 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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