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基礎(chǔ)科研平臺(tái)新蟲 (小有名氣)
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RNA為啥是實(shí)驗(yàn)界“易碎王者”?稍不注意就報(bào)廢
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做分子實(shí)驗(yàn)的寶子誰沒被RNA虐過!提取半天結(jié)果降解、跑膠糊成一團(tuán),明明步驟都對(duì)卻翻車不斷,其實(shí)根源就是它太“嬌弱”,先天+后天全是坑,今天把關(guān)鍵原因扒透 一、自身先天脆弱!單鏈結(jié)構(gòu)扛不住造 RNA和DNA差太多,DNA是雙鏈配對(duì)超穩(wěn)定,RNA卻只有一條單鏈,骨架本身就松散,一點(diǎn)外界刺激就斷鏈; 而且它自帶活性超強(qiáng)的羥基,哪怕常溫放一會(huì)兒,都會(huì)慢慢發(fā)生水解反應(yīng),自然狀態(tài)下都在悄悄變質(zhì),不像DNA能常溫放更久,天生就帶著“易碎體質(zhì)”; 對(duì)溫度、pH超敏感,凍融溫差大、緩沖液pH稍微跑偏,分分鐘就降解失效,比實(shí)驗(yàn)里的其他樣本難伺候10倍! 二、天敵RNase防不勝防!藏哪兒都有還殺不死 RNA最大的敵人就是RNase(RNA酶),這玩意兒簡(jiǎn)直是“降解刺客”,躲都躲不開還難滅活: ? 分布超廣:手上的皮膚、說話濺的唾液、掉的頭發(fā)絲里全有,實(shí)驗(yàn)時(shí)徒手碰樣本、對(duì)著離心管說話,都可能帶進(jìn)去; ? 實(shí)驗(yàn)器材全是隱患:沒做無酶處理的槍頭、離心管,殘留的RNase根本清不干凈,哪怕是新的也可能有殘留;操作臺(tái)、移液槍表面也會(huì)附著,不提前擦除必翻車; ? 耐造到離譜:常規(guī)高壓滅菌(121℃)、反復(fù)凍融都?xì)⒉凰浪,普通清洗完全沒用,微量一點(diǎn)就能快速降解大量RNA,真·防不勝防! 三、實(shí)驗(yàn)踩坑點(diǎn)太多!這些細(xì)節(jié)全是降解誘因 很多時(shí)候翻車不是技術(shù)差,是細(xì)節(jié)沒注意,這些坑千萬別踩: ? 樣本處理太慢:組織/細(xì)胞離體后沒及時(shí)凍存、沒快速裂解,樣本里自帶的RNase會(huì)立刻激活,當(dāng)場(chǎng)就把RNA拆了; ? 器材沒做無酶處理:圖省事用普通槍頭/離心管,沒烤干、沒泡無酶水,RNase直接污染樣本; ? 反復(fù)凍融樣本:RNA凍融一次就傷一次,多次凍融后冰晶會(huì)破壞結(jié)構(gòu),還會(huì)釋放殘留RNase,降解速度翻倍; ? 操作環(huán)境亂:實(shí)驗(yàn)臺(tái)沒提前用RNase抑制劑擦拭,旁邊有人說話、走動(dòng)帶起灰塵,都可能帶入雜質(zhì)引發(fā)降解; ? 試劑失效沒檢查:無酶水放太久、緩沖液污染,哪怕加了RNase抑制劑,試劑出問題也白搭! 最后碎碎念? RNA提取想不翻車,核心就是控RNase+護(hù)結(jié)構(gòu):樣本離體即凍存、全程無酶環(huán)境、少反復(fù)凍融、操作全程冰上做,避開這些坑才能穩(wěn)出好結(jié)果~ 有沒有寶子被RNA坑過?評(píng)論區(qū)說說你的翻車經(jīng)歷 發(fā)自小木蟲手機(jī)客戶端 |
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