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yuan_xjtu鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
請問lammps分子動力學模擬,出現(xiàn)lost atoms問題如何處理?
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請教一個問題,我用lammps模擬的時候,往一個盒子里插入了單條polymer鏈之后對體系進行平衡,模擬運行到一半會自動停止,報錯:Lost atoms,用vmd查看輸出的軌跡發(fā)現(xiàn)最后一幀polymer鏈消失了,另外軌跡文件里可以看到盒子很快縮成很小很小的尺寸(幾乎沒有了)。 請教一下可能是什么地方出現(xiàn)了問題?應(yīng)該從哪些方面考慮修改模型? (平衡過程用的npt,周期性邊界條件,polymer鏈內(nèi)部的原子間用的fene力場) |
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