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| 【懸賞金幣】回答本帖問(wèn)題，作者yuan_xjtu將贈(zèng)送您 10 個(gè)金幣 | ||
yuan_xjtu鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)問(wèn)lammps分子動(dòng)力學(xué)模擬，出現(xiàn)lost atoms問(wèn)題如何處理？
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請(qǐng)教一個(gè)問(wèn)題，我用lammps模擬的時(shí)候，往一個(gè)盒子里插入了單條polymer鏈之后對(duì)體系進(jìn)行平衡，模擬運(yùn)行到一半會(huì)自動(dòng)停止，報(bào)錯(cuò)：Lost atoms，用vmd查看輸出的軌跡發(fā)現(xiàn)最后一幀polymer鏈消失了，另外軌跡文件里可以看到盒子很快縮成很小很小的尺寸（幾乎沒有了）。 請(qǐng)教一下可能是什么地方出現(xiàn)了問(wèn)題？應(yīng)該從哪些方面考慮修改模型？ （平衡過(guò)程用的npt，周期性邊界條件，polymer鏈內(nèi)部的原子間用的fene力場(chǎng)） |
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