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guying03鐵桿木蟲 (小有名氣)
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RNA生物農(nóng)藥技術(shù)層面需要解決的問題
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RNA生物農(nóng)藥技術(shù)層面需要解決的問題 依據(jù)目前的研發(fā)進度,RNA生物農(nóng)藥極有可能在未來幾年上市。目前來看,RNA生物農(nóng)藥在技術(shù)層面上還有一些問題需要解決。 高效RNAi靶標基因的篩選 RNA生物農(nóng)藥優(yōu)勢之一是利用低劑量dsRNA即能夠引起高效RNAi效應(yīng),因此,獲得目標生物高效致死的RNAi靶標基因是研制RNA生物農(nóng)藥的關(guān)鍵。 目前對于靶標基因的篩選和獲得,可以通過(1)已知的病蟲生長發(fā)育過程中的關(guān)鍵基因,作為可能的靶標基因進行篩選;(2)通過相近物種中已知的高效靶標基因的同源序列基因進行篩選;(3)通過測序技術(shù),對病蟲不同組織、不同發(fā)育階段基因進行研究和篩選,從而獲得高效致死作用的靶標基因。 目前,通過這些方式,已經(jīng)獲得多個重要害蟲的靶標基因。但是,在篩選靶標基因的同時,也發(fā)現(xiàn)不同種類昆蟲RNAi效率不同。比如,相比于鞘翅目、直翅目昆蟲來說,鱗翅目昆蟲RNAi效率較低,高效致死作用的靶標基因篩選也相對困難。這可能是由于昆蟲自身特異基因、中腸環(huán)境、RNAi通路機制存在差異而導(dǎo)致的結(jié)果。那么,在針對這類昆蟲靶標基因篩選時,就需要綜合考慮。由于同一靶標基因在不同物種中行使的功能并不完全一致、不同作用機制的靶標基因可能產(chǎn)生抗性程度存在差異、不同物種中RNAi作用機制存在差異,而且都是影響靶標基因作用效果的重要因素,因此,在選擇靶標基因的過程中均需考慮。 dsRNA的生產(chǎn)成本 dsRNA的合成成本是RNA生物農(nóng)藥能否在田間施用的至關(guān)重要的因素。合成dsRNA的方式,主要包括化學(xué)合成、體外合成以及微生物發(fā)酵合成3種方式。 化學(xué)合成成本高,并且隨著dsRNA合成長度的增加,合成錯誤率增加,一般僅適用于實驗室研究的小劑量使用,而不適合大規(guī)模生產(chǎn)。 體外無細胞系統(tǒng)的合成方式主要通過表達dsRNA的元件,之后通過對合成體系進行調(diào)整優(yōu)化,進行體外合成并純化。目前,針對于這種合成方法,美國的Greenlight Biosciences公司研發(fā)了無細胞合成體系,能夠?qū)sRNA的合成成本控制在1美元/g以內(nèi),其成本已經(jīng)能夠滿足田間規(guī);瘧(yīng)用的要求(https://greenlightbiosciences.com/)。 利用微生物發(fā)酵表達合成dsRNA也是目前可能規(guī);瘧(yīng)用的方式之一。已經(jīng)在包括大腸桿菌(Escherichia coli)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)在內(nèi)的多種底盤細胞中構(gòu)建并得到合成dsRNA的菌株,通過提取微生物發(fā)酵產(chǎn)物或者將微生物滅活后,處理相關(guān)的靶標生物,均能夠產(chǎn)生相應(yīng)的RNAi表型。例如加拿大Renaissance BioScience Corp公司通過專屬的酵母載體表達dsRNA,飼喂馬鈴薯甲蟲,能夠精準地抑制靶標基因的表達,并且對馬鈴薯甲蟲致死率高達98.3%,達到保護植株的功效(https://renaissancebioscience.com/)。 dsRNA的穩(wěn)定性 dsRNA屬于核酸類物質(zhì),在復(fù)雜的大田環(huán)境(pH、光照、雨水、微生物等)中或者存在核酸酶的情況下,極其容易發(fā)生降解。因此,RNA生物農(nóng)藥的穩(wěn)定性及貨架期對于RNA生物農(nóng)藥產(chǎn)品的開發(fā)至關(guān)重要。目前,已經(jīng)有多種手段提高dsRNA的穩(wěn)定性。例如,通過納米包被,顯著提高dsRNA的穩(wěn)定性;通過BioClay的包被,能夠顯著提高dsRNA在葉片上的存在時長,增加噴灑型dsRNA的作用效率。同時,也有多家公司專門開展針對于dsRNA穩(wěn)定性的各種助劑以及納米顆粒研發(fā),結(jié)果顯示,添加各種輔助產(chǎn)品后顯著增加dsRNA在環(huán)境及靶標生物體內(nèi)的穩(wěn)定性。 其他需要解決的問題 除了上述幾個主要問題之外,RNA生物農(nóng)藥的遞送效率,RNA生物農(nóng)藥在進行環(huán)境風(fēng)險評估時殘留量的檢測手段等等都是RNA生物農(nóng)藥應(yīng)用之前亟需解決的關(guān)鍵問題。隨著科研機構(gòu)、相關(guān)企業(yè)以及投資機構(gòu)對該領(lǐng)域的進一步深耕,相信這些問題能夠迎刃而解,從而推動RNA生物農(nóng)藥的早日推廣使用。 RNA生物農(nóng)藥的環(huán)境評估及政策層面需要解決的問題 RNA生物農(nóng)藥能否早日實現(xiàn)商業(yè)化應(yīng)用,除了技術(shù)層面的問題之外,還面臨著可能的環(huán)境及政策層面需要解決的問題。 RNA生物農(nóng)藥獲得農(nóng)藥許可證書之前,需要進行環(huán)境風(fēng)險評估。主要包括評估應(yīng)用過程中釋放的dsRNA在環(huán)境中的存在及降解情況,對于非靶標物種的影響,以及對于人類健康存在的可能風(fēng)險。進行殘留檢查時,就需要運用合適的技術(shù)手段進行痕量dsRNA殘留的檢測。 對于dsRNA含量的檢測,目前在實驗室條件下主要采用分光光度計、瓊脂糖凝膠電泳及PCR進行檢測,需要相對專業(yè)的實驗室環(huán)境。同時,由于不同檢測方法的靈敏度存在一定差異,因此需要研發(fā)針對環(huán)境中的痕量dsRNA,進行簡便、快速、高靈敏度的檢測方法。目前,通過放射性同位素32P標記的方法,可以顯著提高檢測環(huán)境中dsRNA的靈敏度。 其次,對于非靶標物種的影響。除了采用傳統(tǒng)的急性及慢性毒理檢測手段之外,根據(jù)RNAi的作用機制,dsRNA僅對能夠良好匹配的目標mRNA產(chǎn)生抑制作用。那么,能否利用生物信息學(xué)手段,對非靶標物種的整個基因組序列進行分析,預(yù)測目標dsRNA可能對于非靶標物種的影響,這種檢測的可信度有多高,能否作為一種技術(shù)手段或者作為一種參考應(yīng)用于RNA生物農(nóng)藥的環(huán)境毒理檢測,也是需要深入探討的重要問題。 文章來源: 關(guān)若冰,李海超,苗雪霞,RNA生物農(nóng)藥的商業(yè)化現(xiàn)狀及存在問題,中國農(nóng)業(yè)科學(xué) |
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