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mishkar新蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助,為什么轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示log2fc<1,而qrtpcr的結(jié)果顯示相差很大
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樓主之前做了轉(zhuǎn)錄組測序,以log2fc>1為限制條件篩選差異基因,結(jié)果顯示有70多個基因下調(diào),100多個基因上調(diào)。其中有幾個基因的log2fc值大概為0.3-0.6之間,但是我用qrtpcr檢測的結(jié)果顯示基因的表達(dá)相差2-5倍,2∧(-ΔΔct)=0.2~0.5左右,雖然這幾個基因在轉(zhuǎn)錄組測序和qrtpcr中的趨勢一樣,但差異倍數(shù)相差得有點(diǎn)大。我重復(fù)做qrtpcr的結(jié)果也是一樣。 請問各位大神,我這種情況應(yīng)該怎么辦?是哪里出了問題了?數(shù)據(jù)可以用嗎? @wizardfan @youlinglyw @biostar2009 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲 (正式寫手)
新蟲 (小有名氣)
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那請問我這種情況應(yīng)該信哪種結(jié)果?轉(zhuǎn)錄組測序告訴我這個基因表達(dá)上調(diào)但是差異倍數(shù)不大,但是qrtpcr告訴我差異顯著 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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