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mishkar新蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助，為什么轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示log2fc＜1，而qrtpcr的結(jié)果顯示相差很大
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樓主之前做了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，以log2fc＞1為限制條件篩選差異基因，結(jié)果顯示有70多個(gè)基因下調(diào)，100多個(gè)基因上調(diào)。其中有幾個(gè)基因的log2fc值大概為0.3-0.6之間，但是我用qrtpcr檢測(cè)的結(jié)果顯示基因的表達(dá)相差2-5倍，2∧（-ΔΔct）=0.2~0.5左右，雖然這幾個(gè)基因在轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和qrtpcr中的趨勢(shì)一樣，但差異倍數(shù)相差得有點(diǎn)大。我重復(fù)做qrtpcr的結(jié)果也是一樣。 請(qǐng)問各位大神，我這種情況應(yīng)該怎么辦？是哪里出了問題了？數(shù)據(jù)可以用嗎？ @wizardfan @youlinglyw @biostar2009 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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yandz680717
木蟲 (正式寫手)
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2樓2022-05-01 09:10:34
mishkar
新蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 植物病理學(xué)
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那請(qǐng)問我這種情況應(yīng)該信哪種結(jié)果？轉(zhuǎn)錄組測(cè)序告訴我這個(gè)基因表達(dá)上調(diào)但是差異倍數(shù)不大，但是qrtpcr告訴我差異顯著 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2022-05-01 12:01:17
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