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半調子梅花鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
關于噬菌體展示抗體篩選過程中抗體序列缺失的問題。
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請教各位大神: 本人從事納米抗體研發(fā)工作,主要運用噬菌體展示技術結合固相篩選法篩選納米抗體,我們構建了一個天然庫,在篩靶點的過程中單克隆phage-ELISA顯示陽性,然后對該克隆進行菌落PCR,發(fā)現(xiàn)條帶明顯比預期短了很多,理論應該是600bp的條帶,卻只有500bp或者250bp,對這個500bp和250bp片段進行測序發(fā)現(xiàn)不是空載,能夠找到正反引物,經(jīng)過比對,這些片段是不完整的抗體序列,其中500bp的條帶有大片段缺失CDR3序列和部分FR序列,而250bp則缺失更多,實際抗體序列只剩下一百多bp,幾乎缺失所有CDR序列和部分FR序列。在建庫的時候我們檢測過庫的陽性率,基本上都是對的序列,幾十個樣本PCR都沒有這種序列,而經(jīng)過誘導噬菌體(輔助噬菌體為M13K07)后就有了,而且在篩選中大量富集,特異性還很高(不跟milk結合)。這個問題很困擾我。哪位大神知道原因和原理,有什么辦法解決。 |
噬菌體展示 |
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