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mrzzy新蟲 (初入文壇)
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[求助]
T載體連接與連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞 已有2人參與
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轉(zhuǎn)化的感受態(tài)細(xì)胞長(zhǎng)不出來,希望大家?guī)兔Ψ治鲆幌驴赡苁悄睦锍隽藛栴}。 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析回來的結(jié)果是,一個(gè)基因長(zhǎng)度為697bp,另一個(gè)基因長(zhǎng)度為660bp。最后擴(kuò)增出來的條帶均在1kbp附近,且無其他明亮條帶。回收濃度分別為37和39 。T載體使用艾德萊的“零背景pTOPO—Blunt Simple平末端克隆試劑盒”,試劑盒剛剛到是新的。感受態(tài)細(xì)胞使用購(gòu)買的維地DH5α。做了三次了,延長(zhǎng)培養(yǎng)時(shí)間至18h,延長(zhǎng)連接時(shí)間(說明書是5min),嚴(yán)格把控?zé)峒r(shí)間,但是最后板子上連個(gè)雜菌都沒有。。。希望哪位大神幫忙分析一下可能是什么問題 |
木蟲 (著名寫手)
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根據(jù)你的描述,可以從以下思路考慮: 1、PCR體系方面,關(guān)于你說的“轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析回來的結(jié)果是,一個(gè)基因長(zhǎng)度為697bp,另一個(gè)基因長(zhǎng)度為660bp。最后擴(kuò)增出來的條帶均在1kbp附近,且無其他明亮條帶”,沒有看太懂什么意識(shí),姑且認(rèn)為你是想表達(dá)目的條帶沒有問題吧。 使用的是平末端T克隆試劑盒,樓主應(yīng)確認(rèn)一下你PCR使用的酶是否合適?是不是也應(yīng)該用PCR產(chǎn)物為平末端的聚合酶?粘性末端的酶是不是應(yīng)該處理成平末端或是否需要磷酸化?(試劑盒里面應(yīng)該有介紹)。 2、連接或轉(zhuǎn)化體系方面,平末端的T載體應(yīng)該比較難自連的,基本上平板要不不長(zhǎng)菌,要不就是陽(yáng)性克隆,假陽(yáng)性概率比較低(載體自連造成)。所以你一直沒有菌生長(zhǎng),可能是片段處理或者轉(zhuǎn)化的問題,試劑盒里面一般有陽(yáng)性對(duì)照樣品,你可以下次實(shí)驗(yàn)時(shí)候做一個(gè)陽(yáng)性對(duì)照和一個(gè)陰性對(duì)照,驗(yàn)證一下是不是試劑盒或者轉(zhuǎn)化條件的問題(也可以和試劑盒公司的技術(shù)支持人員溝通交流一下使用技巧)。 3、確認(rèn)一下平板抗性是否正確或者抗生素是否有問題。 4、T載克隆是比較常常用的一個(gè)實(shí)驗(yàn)技術(shù),因其簡(jiǎn)單易操作(PCR產(chǎn)物可以不用酶切直接連T載體),一般會(huì)用于做亞克隆前的PCR片段測(cè)序,片段的酶切處理或者酶切位點(diǎn)的替換(PCR產(chǎn)物直接雙酶切不易驗(yàn)證是否酶切完全,連了T載體后再酶切易確認(rèn)片段是否被酶切完全)等。 但是T載體克隆并不是基因克隆過程中必須的實(shí)驗(yàn)步驟,現(xiàn)在很多的分子生物學(xué)研究人員基本上不用T載體克隆,直接進(jìn)行片段處理后與目標(biāo)載體連接,測(cè)序等。 所以如果工作在此停滯太久,耽誤實(shí)驗(yàn)進(jìn)程,把簡(jiǎn)單的事情搞的復(fù)雜化了,也就體現(xiàn)不出來T克隆的優(yōu)勢(shì)作用,那么完全可以考慮更換一個(gè)T克隆試劑盒,甚至可以直接跳過T克隆,直接進(jìn)行目的載體的克隆連接。 祝好! |

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