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怎么在一段UTR序列中 分辨出來哪段是SD序列
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- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
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一下純粹摘抄： Shine-Dalgarno （SD）是細(xì)菌和古細(xì)菌中信使RNA中核糖體結(jié)合位點(diǎn)序列。通常位于翻譯起始密碼子AUG上游約8~10個(gè)堿基位置。一般來說，mRNA與核糖體的結(jié)合程度越強(qiáng)，翻譯的起始效率就越大，而這種結(jié)合程度主要取決于SD序列與16S rRNA的堿基互補(bǔ)性，其中以GGAG 4個(gè)堿基序列尤為重要。其中，大腸桿菌的SD序列為AGGAGGU。對多數(shù)基因而言，這4個(gè)堿基中任何一個(gè)換成C或T，均會導(dǎo)致翻譯效率大幅度降低。 換句話說，只有細(xì)菌或古菌的基因5‘UTR有對應(yīng)的SD序列，一般是在ATG密碼子的上游6-10個(gè)堿基位置，核心序列是GGAG，因不同基因或物種可能有變化。 |
2樓2020-12-15 08:41:41
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