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2339773049新蟲 (小有名氣)
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[求助]
怎么在一段UTR序列中 分辨出來哪段是SD序列
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| 請教 怎么在一段UTR序列中 分辨出來哪段是SD序列 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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一下純粹摘抄: Shine-Dalgarno (SD)是細(xì)菌和古細(xì)菌中信使RNA中核糖體結(jié)合位點序列。通常位于翻譯起始密碼子AUG上游約8~10個堿基位置。一般來說,mRNA與核糖體的結(jié)合程度越強,翻譯的起始效率就越大,而這種結(jié)合程度主要取決于SD序列與16S rRNA的堿基互補性,其中以GGAG 4個堿基序列尤為重要。其中,大腸桿菌的SD序列為AGGAGGU。對多數(shù)基因而言,這4個堿基中任何一個換成C或T,均會導(dǎo)致翻譯效率大幅度降低。 換句話說,只有細(xì)菌或古菌的基因5‘UTR有對應(yīng)的SD序列,一般是在ATG密碼子的上游6-10個堿基位置,核心序列是GGAG,因不同基因或物種可能有變化。 |
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