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airpaul金蟲 (小有名氣)
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[求助]
質(zhì)譜數(shù)據(jù)中未注釋的蛋白如何確定功能和分析？
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 各位蟲友大神，我在分析一些蛋白質(zhì)功能的時候遇到一些問題�，F(xiàn)有一種鏈霉菌的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，但目前這個菌的基因組還沒有被注釋，質(zhì)譜結(jié)果只給出了蛋白序列的Accession號，若想盡量多了解這個菌中的蛋白有哪些功能有哪些辦法？目前的想法是通過比對來注釋，但是比對結(jié)果的衡量標(biāo)準(zhǔn)好像沒有比較明確的規(guī)定，不太好把握�；蛘撸瑥挠H緣關(guān)系比較近的菌，注釋信息多一點的入手，例如天藍(lán)色鏈霉菌（模式菌？）比對它的蛋白序列，得到所研究菌的蛋白信息，如何將研究菌質(zhì)譜結(jié)果中的蛋白序列同天藍(lán)色鏈霉菌的蛋白序列進(jìn)行批量比對？望有經(jīng)驗的蟲友不吝賜教 |
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2樓2020-04-10 16:22:49
airpaul
金蟲 (小有名氣)
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3樓2020-04-10 19:40:09
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