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XM沐沐新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關于質(zhì)粒重組,請教大佬們~ 已有2人參與
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| 合成的引物,退火用klenow fragment補齊,酶切后用T4連接酶插入到相同酶切的質(zhì)粒中,通過DH5α轉(zhuǎn)化,沒有菌落長出,是什么問題啊?是質(zhì)粒重組沒有連接上么? |
銅蟲 (小有名氣)
鐵桿木蟲 (著名寫手)
木蟲 (著名寫手)
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導致沒有菌生長的原因有很多,比如,片段酶切處理不完全、載體處理不完全、連接效率過低、感受態(tài)細胞效率低下等等。如果想找到原因還是建議做一些對照實驗,比如可以用空載轉(zhuǎn)感受態(tài),驗證感受態(tài)細胞效率,通過載體自連轉(zhuǎn)化驗證載體處理效果等。 大家經(jīng)常面對的是假陽性比較多,即載體自連。對于樓主出現(xiàn)的連一個菌都不長的情況,首先確定平板抗性正確,然后使用空載體進行轉(zhuǎn)化,驗證感受態(tài)細胞的效率,當然如果感受態(tài)細胞其他人用著可以,那就不用做該對照。 不太清楚樓主的實驗目的,描述的比較簡單,且“合成的引物,退火用klenow fragment補齊”是pcr擴增基因產(chǎn)物?我沒做過,所以不太清楚表達的意思。 其實轉(zhuǎn)化的主要因素就是:片段、載體、連接體系 pcr片段進行酶切時候,最容易出現(xiàn)酶切不完全的情況,因為切下來的堿基少,電泳無法分辨?梢钥紤]連接T載體后,提取質(zhì)粒進行酶切,這樣可以通過電泳檢測片段是否酶切完全。 載體也同樣存在酶切是否完全的問題,特別雙酶切的時候,很多判斷是否兩個酶都酶切完全。這時候我們一般會適當?shù)脑黾用噶亢蜁r間,但這一般不會導致一個菌都不長,會出現(xiàn)載體自連情況。 接下來就是連接,我建議在進行片段和載體連接前,一定進行電泳檢測你的片段和載體濃度,因為我們之前就出現(xiàn)過,對片段載體膠回收后進行連接效率很低,后來發(fā)現(xiàn)回收的片段濃度電泳都看不到,所以根據(jù)經(jīng)驗,還是做個電泳檢測,如果片段濃度可以,那就盡量多的加入片段,載體有一點即可,可以增加轉(zhuǎn)化子的陽性數(shù)。 |

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