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sshhcckk新蟲 (初入文壇)
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[求助]
單細胞基因組測序和轉錄組測序 已有1人參與
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| 請問下大家為什么大部分單細胞測序研究都集中在轉錄組測序？不能在體細胞DNA組發(fā)現(xiàn)新的突變嗎。還是因為在費用或操作技術分析上有局限性？ |
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
sshhcckk: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 明白了謝謝！ 2019-11-20 02:38:46
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sshhcckk: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 明白了謝謝！ 2019-11-20 02:38:46
| 主要還是看目的吧，費用確實有差別，但是單細胞轉錄組和單細胞基因組測序技術和分析上應該是沒什么局限性。轉錄組測序，主要是測mrna，功能基因；基因組就更大了包括外顯子/重復區(qū)域/微衛(wèi)星等等，外顯子部分占的比例非常小，所以如果要測基因組就需要很大的數(shù)據(jù)量，比如人的基因組3G，其中外顯子組才30M左右，所以做gws或者wes數(shù)據(jù)量和測序深度就有很大差別。大部分人關注轉錄組變化，是因為對表型和功能的影響比較直觀，或者說大部分重要的突變集中在轉錄組上。 |
2樓2019-11-17 17:07:41
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