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sshhcckk新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
單細(xì)胞基因組測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 已有1人參與
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| 請(qǐng)問(wèn)下大家為什么大部分單細(xì)胞測(cè)序研究都集中在轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?不能在體細(xì)胞DNA組發(fā)現(xiàn)新的突變嗎。還是因?yàn)樵谫M(fèi)用或操作技術(shù)分析上有局限性? |
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
| 主要還是看目的吧,費(fèi)用確實(shí)有差別,但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和單細(xì)胞基因組測(cè)序技術(shù)和分析上應(yīng)該是沒(méi)什么局限性。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,主要是測(cè)mrna,功能基因;基因組就更大了包括外顯子/重復(fù)區(qū)域/微衛(wèi)星等等,外顯子部分占的比例非常小,所以如果要測(cè)基因組就需要很大的數(shù)據(jù)量,比如人的基因組3G,其中外顯子組才30M左右,所以做gws或者wes數(shù)據(jù)量和測(cè)序深度就有很大差別。大部分人關(guān)注轉(zhuǎn)錄組變化,是因?yàn)閷?duì)表型和功能的影響比較直觀(guān),或者說(shuō)大部分重要的突變集中在轉(zhuǎn)錄組上。 |

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