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新的自我100金蟲 (初入文壇)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
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| 從轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果中篩出一條序列只有700多bp,現(xiàn)在想要克隆,但是在NCBI的BLAST中比對不到任何序列,我要怎么獲得其完整開放閱讀框進行克隆,謝謝。 |
至尊木蟲 (著名寫手)

鐵桿木蟲 (著名寫手)
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通過race技術(shù),最常用的,先克隆出700bp核心序列,然后買race試劑盒。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
你是怎么解決的這個問題,我從轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果里,篩出來的序列有1000多bp,也是在NCBI的BLAST里比對到的序列很少,用OPFfinder預(yù)測開放閱讀框,最長的只有130bp左右,這樣的序列,怎樣設(shè)計引物,獲得開放閱讀框進行克隆。沒人帶著做前邊的生信分析,真的好難呀![]() ![]() 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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