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新的自我100金蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
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| 從轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中篩出一條序列只有700多bp，現(xiàn)在想要克隆，但是在NCBI的BLAST中比對(duì)不到任何序列，我要怎么獲得其完整開(kāi)放閱讀框進(jìn)行克隆，謝謝。 |
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zxd95
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2樓2019-09-08 00:32:37
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西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖交流 2019-11-22 22:31:59
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通過(guò)race技術(shù)，最常用的，先克隆出700bp核心序列，然后買race試劑盒。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
3樓2019-09-08 16:22:45
婉柳
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你是怎么解決的這個(gè)問(wèn)題，我從轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果里，篩出來(lái)的序列有1000多bp,也是在NCBI的BLAST里比對(duì)到的序列很少，用OPFfinder預(yù)測(cè)開(kāi)放閱讀框，最長(zhǎng)的只有130bp左右,這樣的序列，怎樣設(shè)計(jì)引物，獲得開(kāi)放閱讀框進(jìn)行克隆。沒(méi)人帶著做前邊的生信分析，真的好難呀 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
4樓2019-11-22 18:20:05
5樓2020-01-24 14:59:15
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