 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 7 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 6319 | 回復(fù): 6 | |||
[求助]
分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)模擬的區(qū)別？
|
| 如題，請(qǐng)教各位大神，分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)模擬的主要區(qū)別是什么呀？二者側(cè)重解決的問題分別主要是什么呢？ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
307求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
收調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
315食品工程求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
研究生招生
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料與化工，291，求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
0817一志愿蘇州大學(xué)280復(fù)試調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
求調(diào)劑 一志愿蘇州大學(xué)，0856化工323分 | 本科應(yīng)化 | 有專利/競(jìng)賽/科研助手經(jīng)歷 |
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
085602化工求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
083000環(huán)境科學(xué)與工程調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求材料讀博院校
已經(jīng)有9人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
YY_wu2樓2019-04-24 21:58:26
|
分子對(duì)接主要分析預(yù)測(cè)結(jié)合位點(diǎn)，分子動(dòng)力學(xué)是分析結(jié)合構(gòu)象穩(wěn)定性 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
3樓2019-04-25 13:39:53
4樓2019-04-25 16:31:42
5樓2019-04-25 16:33:07
6樓2019-05-24 18:12:49
一代米喲
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: -8.9
- 帖子: 92
- 在線: 10.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 27854282
- 注冊(cè): 2021-11-30
- 性別: GG
- 專業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
【答案】應(yīng)助回帖
| 簡(jiǎn)單來說，分子對(duì)接給你提供了可能的粗糙的結(jié)合模式，因?yàn)閷?duì)接過程中，受體是剛性的，溶劑是沒有的。分子動(dòng)力學(xué)，則是整個(gè)體系都可運(yùn)動(dòng)起來，且考慮了溶劑效應(yīng)，從給定的初始構(gòu)象出發(fā)，對(duì)它進(jìn)行模擬，尋找更合理的結(jié)合模式。因此，在這個(gè)層面上講，可以說分子動(dòng)力學(xué)是高級(jí)的分子對(duì)接。要研究大分子與小分子的相互作用，常規(guī)流程是：先對(duì)接得到復(fù)合物，再跑動(dòng)力學(xué)讓其充分適應(yīng)，獲得更合理更穩(wěn)定的構(gòu)象。分子動(dòng)力學(xué)操作復(fù)雜、計(jì)算量大，比分子對(duì)接麻煩很多。不過，樓主可以搜索一下【蛋白/核酸/多肽-小分子對(duì)接(DOCK6)】和【分子動(dòng)力學(xué)教程 分子動(dòng)力學(xué)模擬（Amber 20）】計(jì)算教程，對(duì)原來的命令行操作做了Web開發(fā)，用瀏覽器就可以訪問使用，不用安裝任何軟件，操作非常簡(jiǎn)單，分析功能非常強(qiáng)大，不妨試試。 |
7樓2021-12-03 15:37:26
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 YY_wu 的主題更新
| 7 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +4 | 超級(jí)伊昂大王 2026-03-10 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑 一志愿蘇州大學(xué)，0856化工323分 | 本科應(yīng)化 | 有專利/競(jìng)賽/科研助手經(jīng)歷 | +7 | 橙子cyx 2026-03-06 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 085602化工求調(diào)劑 +4 | 董boxing 2026-03-10 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 哈工大材料324求調(diào)劑 +4 | 閆旭東 2026-03-10 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 家人們 調(diào)劑不迷路 看這里 +8 | likeihood 2026-03-09 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 新疆大學(xué)地質(zhì)與礦業(yè)工程學(xué)院招生 +24 | another12 2026-03-04 | 32/1600 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +4 | 調(diào)劑的考研學(xué)生 2026-03-09 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 中科大材料299求調(diào)劑 +10 | DAIjiayo 2026-03-05 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 一志愿東北大學(xué)080500，英一數(shù)二343分求調(diào)劑 +7 | Seele_v5 2026-03-04 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 085701環(huán)境工程專碩求調(diào)劑 +5 | 幼稚園大班打手 2026-03-08 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +5 | 好好- 2026-03-07 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿華中科大0702，數(shù)一英一，293 +4 | 小羅露一二 2026-03-07 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +8 | forgman95 2026-03-05 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | 52hz~~ 2026-03-05 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 298 調(diào)劑 +11 | 小西笑嘻嘻 2026-03-03 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 一志愿中石油，化學(xué)工程，301求調(diào)劑 +4 | 豚饅枳枳 2026-03-04 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +4 | 邱gl 2026-03-06 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求調(diào)劑 +7 | 邱gl 2026-03-05 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 紡織、生物、化學(xué)、材料等專業(yè) +3 | Eember. 2026-03-05 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 347求調(diào)劑 +6 | 啊歐歐歐 2026-03-03 | 8/400 |
|