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MJBZ木蟲 (著名寫手)
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[求助]
得到的DNA測序結(jié)果有一個(gè)堿基有錯(cuò)應(yīng)該怎樣分析 已有3人參與
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上課時(shí)，老師出了個(gè)題，一個(gè)DNA測序文件，在第77位機(jī)器測定為C，但是下面的峰可以認(rèn)為是G，根據(jù)學(xué)到的一點(diǎn)皮毛，我把C堿基翻譯成蛋白質(zhì)，把G堿基的翻譯成蛋白質(zhì)，用DNAstar軟件分析序列，發(fā)現(xiàn)這一個(gè)堿基變化，導(dǎo)致翻譯成 兩個(gè)氨基酸殘基，一個(gè)組氨酸一個(gè)蘇氨酸好像（記不清了），我的后面的想法是，把這兩個(gè)堿基有變化的肽鏈看一看改變的氨基酸位置是在可變域還是固定域，用NCBI的BLAST數(shù)據(jù)庫找不同種的生物的同源蛋白，再分析這個(gè)單堿基造成的氨基酸改變是不是致死突變，其他生物的類似蛋白在這個(gè)位置有沒有突變。 我能想到的就是這些，我想問問各位大佬，你們遇到這種情況，是讓公司重測，還是自己分析這個(gè)突變要不要緊，還有分析思考的流程，謝謝。 |
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a13515517892
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6樓2019-02-15 14:52:33
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2樓2019-02-07 08:15:50
MJBZ
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3樓2019-02-07 18:42:18
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drwhoknowss: 金幣+1, 鼓勵(lì)交流 2019-02-11 14:41:47
drwhoknowss: 金幣+1, 鼓勵(lì)交流 2019-02-11 14:41:47
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這個(gè)需要看測序的峰圖，一般來說，前后一百bp左右的測序結(jié)果不是特別準(zhǔn)確的，而且出現(xiàn)一個(gè)bp的堿基不同也是很正常的，同一物種之間也有很多差異位點(diǎn)，可以重新做一個(gè)克隆來看，也可以保留現(xiàn)在的結(jié)果直接用 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2019-02-09 11:41:25
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