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MJBZ木蟲 (著名寫手)
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[求助]
得到的DNA測序結(jié)果有一個堿基有錯應(yīng)該怎樣分析 已有3人參與
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上課時(shí)，老師出了個題，一個DNA測序文件，在第77位機(jī)器測定為C，但是下面的峰可以認(rèn)為是G，根據(jù)學(xué)到的一點(diǎn)皮毛，我把C堿基翻譯成蛋白質(zhì)，把G堿基的翻譯成蛋白質(zhì)，用DNAstar軟件分析序列，發(fā)現(xiàn)這一個堿基變化，導(dǎo)致翻譯成 兩個氨基酸殘基，一個組氨酸一個蘇氨酸好像（記不清了），我的后面的想法是，把這兩個堿基有變化的肽鏈看一看改變的氨基酸位置是在可變域還是固定域，用NCBI的BLAST數(shù)據(jù)庫找不同種的生物的同源蛋白，再分析這個單堿基造成的氨基酸改變是不是致死突變，其他生物的類似蛋白在這個位置有沒有突變。 我能想到的就是這些，我想問問各位大佬，你們遇到這種情況，是讓公司重測，還是自己分析這個突變要不要緊，還有分析思考的流程，謝謝。 |
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MJBZ
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3樓2019-02-07 18:42:18
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2樓2019-02-07 08:15:50
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這個需要看測序的峰圖，一般來說，前后一百bp左右的測序結(jié)果不是特別準(zhǔn)確的，而且出現(xiàn)一個bp的堿基不同也是很正常的，同一物種之間也有很多差異位點(diǎn)，可以重新做一個克隆來看，也可以保留現(xiàn)在的結(jié)果直接用 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2019-02-09 11:41:25
MJBZ
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5樓2019-02-10 20:10:44
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