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moretz銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
怎樣才能確定提取質(zhì)粒 是我的目標(biāo)基因？ 已有1人參與
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各位大神，求教！ 從文獻(xiàn)中查找了目標(biāo)基因的前后引物，然后從生工合成引物后，對實(shí)驗(yàn)室中活性污泥的DNA進(jìn)行擴(kuò)增，跑膠 結(jié)果跑出了亮條帶！ 而后利用該泥樣的DNA進(jìn)行質(zhì)粒提取——vector載體培養(yǎng)，固體培養(yǎng)基，藍(lán)白菌挑菌，液體培養(yǎng)基，然后特異性引物跑膠（跑出了對應(yīng)亮條帶），純化質(zhì)粒后， 又送去生工對質(zhì)粒進(jìn)行測序，現(xiàn)在問題來了！ 測序結(jié)果是 特殊結(jié)構(gòu)，我怎樣才能確定 我提的質(zhì)粒 是我的目標(biāo)基因呢？？ 如何比對？是使用blast嗎？ 非常感謝 快過年了 祝大家新年快樂阿 |
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moretz
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
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- 蟲號(hào): 3079121
- 注冊: 2014-03-22
- 專業(yè): 環(huán)境工程
3樓2019-01-25 21:16:25
2樓2019-01-24 22:42:14
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你可以和blast出來的序列比較一下看看，是不是兩端不匹配造成的同源性差異，我用ncbi里面有一個(gè)vector 的工具，具體叫啥忘了，就在ncbi首頁或blast拉到最下面的一堆工具里。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2019-01-26 01:09:03
5樓2019-01-26 01:51:08
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