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冷凍電鏡技術(shù)是什么?原理、應(yīng)用與發(fā)展深度解讀
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冷凍電子顯微鏡(Cryo-electron microscopy,簡(jiǎn)稱Cryo-EM)是指對(duì)冷凍樣品進(jìn)行電子顯微鏡觀察的技術(shù)。其目的是盡可能觀察樣品接近天然狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)。該技術(shù)特別適用于含水樣品,因此已成為研究生物樣本的重要工具。 一、發(fā)展背景 冷凍電子顯微鏡的誕生經(jīng)歷半世紀(jì)之久。20世紀(jì)30年代,在Ernst Ruska研制出第一臺(tái)電子顯微鏡后不久,Ladislaus Marton意識(shí)到,使用這種儀器研究生物樣品時(shí),“有機(jī)細(xì)胞會(huì)因強(qiáng)烈的電子轟擊而遭到破壞”。他提出,需要開發(fā)新的樣品制備技術(shù),例如對(duì)樣品進(jìn)行冷卻。20世紀(jì)50年代,Humberto Fernández-Morán首次進(jìn)行了低溫電子顯微鏡實(shí)驗(yàn),但樣品在冷凍過程中因形成冰晶而受到損傷。20世紀(jì)70年代中期,Taylor和Glaeser發(fā)現(xiàn),冷卻樣品可提高其對(duì)輻射損傷的耐受性。然而,直到20世紀(jì)80年代,Jacques Dubochet找到了一種不產(chǎn)生冰晶的樣品冷凍方法,現(xiàn)代低溫電子顯微鏡才真正誕生。 冷凍電鏡技術(shù)主要面臨三個(gè)挑戰(zhàn)。 1、在樣品制備、轉(zhuǎn)移至顯微鏡以及在顯微鏡中觀察過程中,需要保持樣品處于低于-140°C的低溫狀態(tài)。 2、電子束敏感性。即使在冷凍條件下,樣品也極易受到電子束輻射的損傷,因此透射電鏡(TEM)通常采用低劑量條件成像,掃描電鏡(SEM)則采用低電壓成像。 3、在冷凍透射電鏡中,信號(hào)來源于電子束與樣品的直接相互作用,卻沒有使用重金屬染色來增強(qiáng)對(duì)比度,由于信噪比(SNR)較差,導(dǎo)致成像質(zhì)量不高。 二、實(shí)驗(yàn)流程 冷凍電鏡首先通過超低溫冷凍技術(shù)固定生物大分子或材料,利用透射電子顯微鏡(TEM)觀測(cè)其三維結(jié)構(gòu)。其核心原理可概括為以下三步: 1、低溫固定:將含水樣品(如蛋白質(zhì)溶液、細(xì)胞組織)快速浸入-196℃的液氮冷卻乙烷中,數(shù)毫秒內(nèi)實(shí)現(xiàn)“玻璃化凍結(jié)”——避免傳統(tǒng)冷凍導(dǎo)致的冰晶損傷,,而是轉(zhuǎn)化為無定形的玻璃態(tài)冰,完美鎖定樣品的天然構(gòu)象。 2、電子成像:在液氦溫度(4.3K)或液氮溫度(77K)下,電子束穿透樣品形成二維投影圖像。由于生物分子結(jié)構(gòu)復(fù)雜,需從數(shù)百至上百萬張不同角度的投影圖中提取信息。 3、三維重構(gòu):利用計(jì)算機(jī)算法對(duì)數(shù)千張不同角度的二維圖像進(jìn)行分類、對(duì)齊與平均處理,通過迭代重投法、自適應(yīng)建模等技術(shù),反向推算出樣品的三維結(jié)構(gòu)模型。如今,該技術(shù)已能實(shí)現(xiàn) 1.8埃 的近原子分辨率(1Å=0.1 納米),清晰呈現(xiàn)蛋白質(zhì)的氨基酸側(cè)鏈、核酸的堿基配對(duì)等細(xì)節(jié)。 三、冷凍電鏡分析技術(shù) 近年來,“冷凍電鏡”這一術(shù)語僅被用于指代冷凍透射電子顯微鏡的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。然而,冷凍電鏡實(shí)際上還包括兩種被廣泛使用的技術(shù)——單顆粒分析(SPA)與冷凍電子斷層掃描(Cryo-ET)。 那么需要關(guān)注的是,我需要采用單顆粒分析還是冷凍電子斷層掃描呢? 單顆粒分析(SPA)技術(shù)針對(duì)純化后的生物大分子(如蛋白質(zhì)、病毒、核酸復(fù)合物),利用其在溶液中隨機(jī)取向的特性,采集數(shù)十萬甚至數(shù)百萬張單顆粒二維投影圖像,通過計(jì)算機(jī)算法進(jìn)行分類、對(duì)齊與三維重構(gòu),最終獲得高分辨率三維結(jié)構(gòu)。該技術(shù)無需樣品結(jié)晶,僅需微量純化樣品即可實(shí)現(xiàn)解析,尤其適用于異質(zhì)性強(qiáng)、難結(jié)晶的大分子復(fù)合物。 優(yōu)勢(shì): Ø 解析生物大分子的分辨率最高可達(dá)原子級(jí)(~1-3Å)。 Ø 樣品受總輻射值小。 Ø 對(duì)稱顆粒的解析分辨率更高,是獲取其精細(xì)結(jié)構(gòu)的黃金標(biāo)準(zhǔn)。 Ø 適合分子量大的樣品。分子量越大,結(jié)果越好。 冷凍電子斷層掃描(Cryo-ET)類比醫(yī)院電腦斷層掃描斷層掃描技術(shù),通過旋轉(zhuǎn)樣品臺(tái)(傾斜角度范圍-60°至+60°),對(duì)冷凍后的細(xì)胞、組織或原位樣品進(jìn)行多角度二維成像,獲取40-60張不同角度的投影圖,再基于“中心截面定理”進(jìn)行三維重構(gòu),形成樣品的三維斷層圖像。結(jié)合子斷層圖像平均法(STA),分辨率最高可達(dá)3Å,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)原位生物大分子的結(jié)構(gòu)觀測(cè)。該技術(shù)通常應(yīng)用于細(xì)胞層面的研究,用于分析細(xì)胞器的結(jié)構(gòu)及其相互之間的關(guān)系,并可應(yīng)用于完整的小型樣品(如細(xì)菌)的觀察。對(duì)于較大較厚的樣品,則需要進(jìn)行切片減薄處理。該技術(shù)的重要性在于,它能夠在細(xì)胞內(nèi)天然環(huán)境中揭示分子結(jié)構(gòu)的真實(shí)形態(tài)。 優(yōu)勢(shì): Ø 保存原始空間背景,直接展示目標(biāo)分子在細(xì)胞原生環(huán)境(原位)中的真實(shí)狀態(tài)、位置和與其他細(xì)胞器的空間關(guān)系。 Ø 作為一種"無假設(shè)"的觀測(cè)方法,可以在復(fù)雜的細(xì)胞環(huán)境中發(fā)現(xiàn)新的結(jié)構(gòu)或已知分子的未知組裝形式。 Ø 簡(jiǎn)單直接,對(duì)樣品的要求較低。 四、低溫電鏡在結(jié)構(gòu)生物學(xué)的應(yīng)用 新冠病毒刺突蛋白的動(dòng)態(tài)構(gòu)象 清華大學(xué)李賽團(tuán)隊(duì)與浙江大學(xué)李蘭娟團(tuán)隊(duì)合作解析出新冠病毒全病毒三維結(jié)構(gòu),對(duì)疫苗及抗體研發(fā)、疫情防控宣傳、科普教育、分子動(dòng)力學(xué)模擬等具有十分重要作用,為疫苗設(shè)計(jì)提供了關(guān)鍵依據(jù)。 噬藻體A4的侵染機(jī)制 中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)周叢照?qǐng)F(tuán)隊(duì)解析了侵染模式藍(lán)藻魚腥藻PCC 7120的肌尾噬藻體A-1(L)尾部機(jī)器的完整三維結(jié)構(gòu),揭示了噬藻體A-1(L)與其特異性宿主藍(lán)藻相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和分子機(jī)制。有助于深入理解噬藻體與宿主藍(lán)藻相互作用的分子機(jī)制,為將來開發(fā)環(huán)境友好型底盤噬藻體奠定理論基礎(chǔ)。 阿爾茨海默病 tau 蛋白的聚集體結(jié)構(gòu) 英國利茲大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)掃描了阿爾茨海默病患者的死后腦組織,發(fā)現(xiàn)阿爾茨海默病患者大腦中的β-淀粉樣蛋白中存在混合的微觀絲狀結(jié)構(gòu),稱為纖維絲,以及其他結(jié)構(gòu)。為揭示阿爾茨海默病的發(fā)展機(jī)制提供了方向。并且還能啟示科學(xué)家用于分析其他神經(jīng)退行性疾病的根本原因。 五、達(dá)遠(yuǎn)辰光Cryo-EM結(jié)構(gòu)解析技術(shù)平臺(tái) 深圳達(dá)遠(yuǎn)辰光科技有限公司由大學(xué)教授、歸國技術(shù)專家以及深耕生物技術(shù)市場(chǎng)數(shù)十年的資深專家共同創(chuàng)立,技術(shù)力量雄厚,在結(jié)構(gòu)生物學(xué)方面積累了豐富的行業(yè)經(jīng)驗(yàn),始終致力于為廣大生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)提供從蛋白表達(dá)純化到蛋白功能研究和結(jié)構(gòu)解析服務(wù),以滿足各種科研及新藥開發(fā)研究需求,兼具快速交付、卓越品質(zhì)和跨團(tuán)隊(duì)/跨平臺(tái)的高效協(xié)同優(yōu)勢(shì)。 服務(wù)優(yōu)勢(shì) Ø 快速交付 達(dá)遠(yuǎn)辰光由具備多學(xué)科專業(yè)知識(shí)的冷凍電鏡專家團(tuán)隊(duì)支撐,提供一站式定制化服務(wù),最快可一個(gè)月交付項(xiàng)目。 Ø 平臺(tái)資源充足 具備多個(gè)實(shí)驗(yàn)平臺(tái)的冷凍電鏡資源,專業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),可以及時(shí)迅速地開啟項(xiàng)目,適應(yīng)項(xiàng)目中的不同需求,加速研究進(jìn)展,提升研發(fā)能力。 Ø 性價(jià)比高 低于同行業(yè)的服務(wù)價(jià)格,高于同行業(yè)的服務(wù)質(zhì)量。 |
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