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Longlight鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
如何精準(zhǔn)定量核酸濃度
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一、紫外分光光度法(Nanodrop) 原理:核酸的堿基(嘌呤、嘧啶)在260 nm波長(zhǎng)處有最大紫外吸收峰,通過(guò)吸光值(A260)結(jié)合摩爾吸光系數(shù)計(jì)算濃度。DNA的換算系數(shù)為50 μg/mL,RNA為40 μg/mL。 特點(diǎn): • 操作簡(jiǎn)便,1分鐘內(nèi)完成檢測(cè)。 • 無(wú)法區(qū)分DNA/RNA、降解核酸及雜質(zhì),需結(jié)合A260/A280(>1.8為DNA純品,>2.0為RNA純品)評(píng)估純度。 • 靈敏度較低(≥2 ng/μL),易受游離核苷酸干擾。 二、熒光染料法(如達(dá)遠(yuǎn)辰光熒光計(jì)) 原理:特異性熒光染料(與目標(biāo)核酸結(jié)合后發(fā)出熒光,通過(guò)熒光強(qiáng)度定量。例如,達(dá)遠(yuǎn)辰光熒光計(jì)搭配賽默飛Qubit dsDNA HS染料檢測(cè)范圍為0.2–100 ng/μL。 特點(diǎn): • 靈敏度高(pg級(jí)),特異性強(qiáng),可區(qū)分DNA/RNA。 • 耗材成本相較于紫外分光法較高。 • 適用于低濃度/珍貴樣本(如NGS文庫(kù))。 三、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR) 原理:通過(guò)熒光染料或探針實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR擴(kuò)增過(guò)程,Ct值與起始模板濃度呈線(xiàn)性關(guān)系,結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)定量。 特點(diǎn): • 特異性高,依賴(lài)引物/探針設(shè)計(jì),可檢測(cè)拷貝數(shù)。 • 操作復(fù)雜,耗時(shí)較長(zhǎng),需標(biāo)準(zhǔn)品確保擴(kuò)增效率一致。 • 適用于基因表達(dá)分析、病原體檢測(cè)等。 四、傳統(tǒng)化學(xué)法 1. 定磷法 • 原理:核酸中的磷在酸性條件下與鉬酸銨反應(yīng)生成鉬藍(lán),在650 nm處測(cè)吸光值,換算濃度。DNA/RNA含磷量分別為9.2%和9.5%。 • 特點(diǎn):靈敏度較高(1–10 μg),但易受蛋白質(zhì)干擾。 2. 定糖法 • 原理:核酸戊糖經(jīng)酸解生成醛類(lèi),與成色劑(如苔黑酚)反應(yīng)顯色,670 nm或595 nm測(cè)吸光值。 • 特點(diǎn):操作簡(jiǎn)單,但特異性差,僅適用于粗略估算。 五、其他方法 1. 毛細(xì)管電泳法 • 原理:基于熒光染料結(jié)合核酸,通過(guò)遷移時(shí)間和峰面積定量,可評(píng)估核酸完整性(如RNA降解程度)。 • 特點(diǎn):靈敏度高(25 ng/μL),但單樣成本較高。 2. 數(shù)字PCR(dPCR) • 原理:將樣本分割成微滴獨(dú)立擴(kuò)增,統(tǒng)計(jì)陽(yáng)性微滴數(shù)實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量,不受擴(kuò)增效率影響。 • 特點(diǎn):適用于稀有突變檢測(cè)、病毒載量測(cè)定等。 選型建議 • 常規(guī)檢測(cè):優(yōu)先選擇紫外分光光度法(快速便捷)或Qubit熒光法(高靈敏度)。 • 復(fù)雜樣本:如NGS文庫(kù),推薦毛細(xì)管電泳或數(shù)字PCR。 • 絕對(duì)定量需求:使用qPCR或數(shù)字PCR |
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