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[學習資料分享] FAERS數(shù)據(jù)庫的不良反應挖掘(頻數(shù)法/貝葉斯法)
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還有研究這個方向的同學嗎？這個課題是我兩年前摸過的，現(xiàn)在感覺已經(jīng)被水爛了。 分享當時用到的整理資料和一些代碼發(fā)布出來，給大家參考，截圖不全，需要的可以聯(lián)系我郵箱GUAN22apply@163.com。 用的Annoconda環(huán)境，python編程，拿到數(shù)據(jù)庫可以直接運行測試，各種算法結(jié)果和描述性統(tǒng)計信息均會保存 鏈接: https://pan.baidu.com/s/1gZDE00og40Po4t0XNCRJ5g?pwd=a3e4 提取碼: a3e4 復制這段內(nèi)容后打開百度網(wǎng)盤手機App，操作更方便哦  |
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基礎的循環(huán)條件： for pt in tqdm(pt_goal): a = REAC_GOAL.loc[REAC_GOAL['pt'] == pt]['primaryid'].nunique() b = goal_report - a c = REAC.loc[REAC['pt'] == pt]['primaryid'].nunique() - a d = all_report - a - b - c # Calculate ROR ror = (a*d)/(b*c) selnror = (1/a + 1/b +1/c +1/d)**0.5 low_95cl = (math.e)**(math.log(ror)-1.96*selnror) # Calculate PRR PRR = (a/(a+b))/(c/(c+d)) x_sq = (((abs(a*d - b*c)-n*0.5)**2)*n)/((a+b)*(a+c)*(b+d)*(c+d)) |
2樓2025-03-07 15:17:16
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