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香飄飄紅豆新蟲 (初入文壇)
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[交流]
空間轉(zhuǎn)錄組
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為什么要做空間轉(zhuǎn)錄組？ 1. 細(xì)胞類型鑒定完之后，可能會(huì)發(fā)現(xiàn)對(duì)照組和處理組的細(xì)胞類型差不多，但是表型卻大同小異。同樣類型的細(xì)胞，為什么在不同樣本中的表現(xiàn)差異如此之大？基因表達(dá)不同的緣故嗎？那又是什么因素導(dǎo)致相同類型的細(xì)胞基因表達(dá)差異如此之大？ 2. 通過降維聚類，特征相似的細(xì)胞聚集在一起�；虮磉_(dá)相似，便代表這一群細(xì)胞行駛的功能是一樣的嗎？既然特征相似，為什么細(xì)胞和細(xì)胞之間，在二維平面上的分布還是有一定距離？聚類之后的細(xì)胞分布，和細(xì)胞在組織上的真實(shí)分布有什么關(guān)系？ 3. 細(xì)胞的異質(zhì)性是真實(shí)存在的，而在單細(xì)胞水平下是研究是以群（cluster）為最小單元，這樣分析是否合理？以群為單位，是否會(huì)掩蓋或忽略掉細(xì)胞之間的關(guān)鍵信息？ 4. 單細(xì)胞水平下分析得到的細(xì)胞分化發(fā)育軌跡，或細(xì)胞和細(xì)胞之間的通訊聯(lián)系，在空間上是否真實(shí)分布在臨近區(qū)域？不同細(xì)胞之間的聯(lián)系，是直接，還是間接？或者反過來，單細(xì)胞水平下分析得到的功能相似的細(xì)胞群體，在組織中的分布，一定是在同一區(qū)域嗎？ 這些問題，如果僅僅靠單細(xì)胞一個(gè)層面的數(shù)據(jù)，是很難解釋清的。所以需要在單細(xì)胞的基礎(chǔ)上，聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組，二者相互印證，才能獲取更真實(shí)的信息。 所以現(xiàn)在選擇我們只需要10999哦  |
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