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《Advanced Materials》:蠶絲蛋白對(duì)干細(xì)胞功能調(diào)節(jié)和組織再生修復(fù)的效應(yīng)和機(jī)制 已有1人參與
中國(guó)作為最早繅絲養(yǎng)蠶的國(guó)家,孕育的蠶絲文化源遠(yuǎn)流長(zhǎng)。隨著科技的進(jìn)步及多學(xué)科的交叉融合,蠶絲的應(yīng)用已不局限于傳統(tǒng)的紡織領(lǐng)域,其在組織工程和再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域亦展現(xiàn)出巨大的潛力。絲素蛋白(SF)和絲膠蛋白(SS)是蠶絲的兩種主要蛋白,是一種極具吸引力的生物材料,在組織工程和再生醫(yī)學(xué)中具有很大的應(yīng)用潛力。然而,它們與干細(xì)胞的生化相互作用尚不清楚。為探究蠶絲材料內(nèi)在生化信號(hào),闡明其對(duì)細(xì)胞功能和組織再生的整體影響,東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院張薇/陳佳林團(tuán)隊(duì)首次采用多組學(xué)測(cè)序全面解析了蠶絲蛋白介導(dǎo)的細(xì)胞響應(yīng)及分子機(jī)制,在深入的高通量分子水平上闡明干細(xì)胞-蠶絲材料之間的相互作用,為蠶絲生物材料在組織工程和干細(xì)胞治療領(lǐng)域的應(yīng)用提供更加全面的見解。
相關(guān)論文以“ Silk fibroin and sericin differentially potentiate the paracrine and regenerative functions of stem cells through multiomics analysis”為題,發(fā)表在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊Advanced Materials(IF=32.086)上。
首先,研究團(tuán)隊(duì)評(píng)估了SF和SS對(duì)間充質(zhì)干細(xì)胞(MSCs)的細(xì)胞行為和功能的影響。研究者使用細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒8(CCK-8)測(cè)定了MSC在暴露于0.01%至1%(w/v)各種濃度的SF和SS時(shí)的增殖情況。在不同濃度SF和SS下分別培養(yǎng)1,3,7天,MSCs增值正常(圖1C、D)。結(jié)果表明0.2%(w/v)SF和SS都顯著促進(jìn)了MSC的增殖,這與之前的報(bào)道一致,即SF和SS可以作為生物活性分子來支持組織工程應(yīng)用中的細(xì)胞增殖。由于0.2%(w/v)SF或SS處理的MSC增殖水平較高,因此選擇該特定濃度進(jìn)行以下實(shí)驗(yàn);/死細(xì)胞染色結(jié)果顯示無論有沒有SF或SS處理,MSC在處理后的第1、3和7天均表現(xiàn)出高細(xì)胞活力,SF和SS對(duì)MSCs的增殖和活力有輕微的促進(jìn)作用(圖1E)。之后使用Alamar Blue測(cè)定方法評(píng)估SF和SS對(duì)MSC代謝(線粒體)活動(dòng)的影響,并且在這三組之間未觀察到顯著差異(圖1F)。F-肌動(dòng)蛋白染色和劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示SF和SS可以促進(jìn)MSC中F-肌動(dòng)蛋白的形成(圖1G),但是SF或SS并未顯著提高M(jìn)SCs遷移能力。最后通過進(jìn)行ALP、油紅O和阿爾新藍(lán)染色評(píng)估了用/不用SF或SS處理的MSC的成骨、脂肪和軟骨形成分化,但SF和SS對(duì)MSCs的分化潛能無顯著影響(圖1I-K)。SF和SS在促進(jìn)干細(xì)胞增殖和活力方面的有限生物活性似乎不足以闡明SF和SS在絲基組織工程和再生醫(yī)學(xué)中的引人注目的治療作用,需要進(jìn)一步的探討。
之后,研究團(tuán)隊(duì)通過多組學(xué)解析了SF和SS介導(dǎo)的細(xì)胞響應(yīng),發(fā)現(xiàn)SF和SS分別通過Integrin/PI3K/Akt和糖酵解信號(hào)通路顯著增強(qiáng)MSCs的旁分泌功能,這些功能涉及細(xì)胞外基質(zhì)沉積、血管生成和免疫調(diào)控等多種組織再生關(guān)鍵過程。
蛋白組學(xué)分析結(jié)果顯示在SF和對(duì)照組中,我們確定了幾個(gè)與“表皮發(fā)育”、“角化”、“細(xì)胞粘附”、“皮膚發(fā)育”、“角質(zhì)形成細(xì)胞分化”、“表皮發(fā)育的正調(diào)節(jié)”、“周圍神經(jīng)系統(tǒng)軸突再生”、“上皮細(xì)胞分化”和“傷口愈合”相關(guān)的關(guān)鍵GO術(shù)語(yǔ)(圖2G)。同樣,在SS和對(duì)照組之間,幾個(gè)BP的GO術(shù)語(yǔ)(包括“表皮發(fā)育”、“細(xì)胞外基質(zhì)組織”、“細(xì)胞粘附”、“膠原纖維組織”、“角化”、“糖酵解過程”、“調(diào)節(jié)細(xì)胞粘附”、“細(xì)胞生長(zhǎng)調(diào)節(jié)”、“上皮細(xì)胞分化”和“傷口愈合”)與對(duì)照組相比,顯著豐富(圖2H)。這些結(jié)果強(qiáng)烈表明,MSC響應(yīng)SF和SS提供的旁分泌信號(hào)具有調(diào)節(jié)皮膚修復(fù)和再生的潛力。隨后,KEGG分析顯示,SF組中分泌蛋白組的變化與多種細(xì)胞通路相關(guān),包括“ECM-受體相互作用”、“PI3K/Akt信號(hào)通路”、“粘著斑”和“補(bǔ)體與凝血級(jí)聯(lián)”(圖2I)。除了這些途徑外,“果糖和甘露糖代謝”、“HIF-1信號(hào)通路”和“糖酵解/糖異生”還從SS與Ctrl中MSC顯著變化的旁分泌產(chǎn)物中得到豐富(圖2J)。這些信號(hào)通路從SF或SS處理后改變的MSCs分泌蛋白組中富集,與我們的RNA-seq數(shù)據(jù)高度一致,證實(shí)了這些旁分泌信號(hào)在細(xì)胞對(duì)SF和SS的反應(yīng)中的關(guān)鍵作用。由于RNA-seq結(jié)果顯示與生長(zhǎng)因子和膠原相關(guān)ECM相關(guān)的基因發(fā)生顯著變化,我們專門研究了它們相應(yīng)蛋白質(zhì)的分泌(圖2K)。與我們的RNA-seq數(shù)據(jù)一致,觀察到這些蛋白質(zhì)的表達(dá)和分泌發(fā)生顯著變化,并且SF組的膠原蛋白(COL1A1、COL1A2、COL4A1、COL5A2、COL6A1和COL6A3)和生長(zhǎng)因子(胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白(IGFBP)3、IGFBP4和IGFBP7)優(yōu)于Ctrl或SS組(圖2K)。
最后,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)這些由SF和SS介導(dǎo)的旁分泌信號(hào)對(duì)皮膚傷口愈合的多種生物過程具有調(diào)控作用。因此,研究團(tuán)隊(duì)分別在體內(nèi)外驗(yàn)證了SF和SS介導(dǎo)的旁分泌信號(hào)可通過調(diào)節(jié)皮膚微環(huán)境中多種常駐細(xì)胞(包括成纖維細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞和巨噬細(xì)胞)的行為和功能,進(jìn)而有效促進(jìn)皮膚再生。
為了探究MSCs旁分泌產(chǎn)物的影響,收集了用/不用SF或SS處理的MSC的CM,并將其應(yīng)用于成纖維細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的培養(yǎng)(圖3A)。為了評(píng)估來自MSCs的旁分泌信號(hào)對(duì)皮膚修復(fù)的潛力,首先研究了它們對(duì)人類真皮成纖維細(xì)胞行為的影響。CCK-8測(cè)定表明SF或SS誘導(dǎo)的MSCs的這些旁分泌信號(hào)在促進(jìn)成纖維細(xì)胞增殖(圖3B)。此外,與第1天的Ctrl CM相比,SS CM略微增加了成纖維細(xì)胞的細(xì)胞活力(圖3C)。隨后使用劃痕試驗(yàn)評(píng)估了不同CM對(duì)成纖維細(xì)胞遷移的影響。代表性圖像和定量分析表明,與 Ctrl CM 和 SF CM 相比,SS CM 顯著促進(jìn)了成纖維細(xì)胞的遷移,而 SF CM 對(duì)成纖維細(xì)胞沒有明顯的促遷移作用(圖 3D)?傊,這些發(fā)現(xiàn)表明,SF 誘導(dǎo)的 MSCs 分泌旁分泌因子可以促進(jìn)成纖維細(xì)胞增殖,而 SS 刺激的信號(hào)增強(qiáng)成纖維細(xì)胞的增殖、活力和遷移。
SF水凝膠和SS水凝膠在大鼠體內(nèi)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明SF和SS通過誘導(dǎo)MSCs的旁分泌作用,顯著增加創(chuàng)面愈合,促進(jìn)皮膚修復(fù)和再生。作者成功建立了大鼠全層皮膚缺損模型,并應(yīng)用 MSC 種子水凝膠來評(píng)估 MSC 與 SF 或 SS 相互作用的旁分泌信號(hào)對(duì)體內(nèi)傷口愈合的影響。總的來看, SF 和 SS 水凝膠之間的傷口愈合率沒有顯著差異,表明 SF 和 SS 對(duì) MSCs 在加速傷口愈合方面的作用相當(dāng)(圖4A-C)。
染色結(jié)果表明所有三組都顯示出完整的表皮再生以及真皮區(qū)域形成良好且完整的膠原樣組織形成。然而,SF 和 SS 水凝膠中存在明顯的皮膚附屬物,其特征是真皮的完全重塑,但 Ctrl 水凝膠中沒有(圖 4D-E)。皮膚厚度的定量分析表明,與 Ctrl 水凝膠組(1.46 毫米)相比,SF(1.86 毫米)和 SS(1.88 毫米)水凝膠組的皮膚厚度顯著增加,而 SF 和 SS 水凝膠之間沒有顯著差異組(圖 4F)。此外,SF 和 SS 增強(qiáng)了新形成的皮膚組織的血管生成,新血管的數(shù)量和橫截面積明顯高于 Ctrl 水凝膠組(圖4G-H),這可能歸因于更高的分泌SF 和 SS 水凝膠組中 MSCs 的血管生成因子。此外,在SF和SS水凝膠中觀察到的毛囊數(shù)量高于Ctrl水凝膠(圖4I)。這些結(jié)果表明,SF 和 SS 水凝膠在結(jié)構(gòu)和功能上都誘導(dǎo)了增強(qiáng)的皮膚修復(fù)和再生。
最后,比較SF和SS水凝膠組之間的差異。為了全面評(píng)估不同處理后的傷口微環(huán)境,對(duì)第14天大鼠再生皮膚組織樣本(每組n = 3只大鼠)進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析(圖5A)。聚類分析后的所有鑒定蛋白熱圖顯示,Ctrl、SF和SS水凝膠組之間的蛋白表達(dá)存在差異(圖5B)。采用Ctrl、SF、SS水凝膠組進(jìn)行兩兩比較,鑒定DEPs (p < 0.05),結(jié)果發(fā)現(xiàn)SF和Ctrl水凝膠組之間有78個(gè)蛋白差異表達(dá),其中47個(gè)蛋白上調(diào),31個(gè)蛋白下調(diào)(圖5C)。在SS和Ctrl水凝膠組中,我們檢測(cè)到79個(gè)DEPs,其中38個(gè)上調(diào),41個(gè)下調(diào)(圖5D)。此外,SF水凝膠組與SS水凝膠組比較,發(fā)現(xiàn)32個(gè)DEPs上調(diào),15個(gè)DEPs下調(diào)(圖5E)。在這些DEPs中,分別有39和58個(gè)DEPs是SF vs Ctrl和SS vs Ctrl特異性的,只有9個(gè)DEPs是SF vs SS特異性的(圖5F)。圖5G,H揭示了不同處理后創(chuàng)面環(huán)境更重要的變化。為了進(jìn)一步了解傷口微環(huán)境中DEPs的功能,我們進(jìn)行了氧化石墨烯富集分析。在SF和Ctrl組中,幾個(gè)BP GO術(shù)語(yǔ)從DEPs上調(diào)中顯著富集,包括“傷口愈合”、“膠原纖維組織”和“突觸可塑性的積極調(diào)節(jié)”(圖5I)。此外,與Ctrl水凝膠組相比,SF水凝膠組CC和MF的氧化石墨烯術(shù)語(yǔ)有幾個(gè)顯著上調(diào),如“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)成分”、“膠原結(jié)合”和“血小板衍生生長(zhǎng)因子結(jié)合”(圖5J),這可能是由MSCs的旁分泌信號(hào)介導(dǎo)的。此外,為了克服DEPs分析的局限性,進(jìn)行了基因集富集分析(GSEA),發(fā)現(xiàn)SF水凝膠激活了“傷口愈合調(diào)節(jié)”、“組織重塑”和“軸突引導(dǎo)”,同時(shí)抑制了傷口愈合過程中的“白細(xì)胞趨化性”,導(dǎo)致SF水凝膠組與Ctrl水凝膠組相比,皮膚再生能力增強(qiáng)(圖5K)。就SS與Ctrl而言,我們發(fā)現(xiàn)BP和MF的重要GO術(shù)語(yǔ)中增強(qiáng)了“糖酵解過程”、“糖異生”和“磷酸丙酮酸水合酶活性”(圖5L),表明SS水凝膠組創(chuàng)面糖酵解增強(qiáng)。KEGG分析和GSEA也證實(shí)了這一點(diǎn)(圖5N)。我們還觀察到一些下調(diào)的bp有助于加速傷口愈合,包括“負(fù)調(diào)控成纖維細(xì)胞增殖”、“負(fù)調(diào)控壞死細(xì)胞死亡”和“負(fù)調(diào)控凋亡過程”(圖5L)。CC的重要GO術(shù)語(yǔ)顯示“細(xì)胞外泌體”和“突觸后密度”上調(diào)(圖5M),表明傷口愈合過程中旁分泌和神經(jīng)信號(hào)的傳遞得到改善。此外,觀察到HIF-1信號(hào)也從幾種糖酵解相關(guān)的DEPs (SS vs Ctrl)中富集,包括PGK1, ALDOA, ENO2, ENO3, GAPDH,證實(shí)了SS水凝膠處理皮膚傷口的代謝轉(zhuǎn)換為糖酵解(圖5N)。SS和SF對(duì)比,SF在皮膚修復(fù)方面更加優(yōu)異(圖5P)
在這項(xiàng)研究中,我們應(yīng)用多組學(xué)技術(shù)全面闡明了SF和SS與MSC的生化相互作用,并分析了BP和分子活性的變化。轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組綜合分析一致表明,SF和SS啟動(dòng)了廣泛但不同的細(xì)胞反應(yīng),并增強(qiáng)了MSC的旁分泌功能,這些功能通過整合蛋白/PI3K/Akt和糖酵解信號(hào)通路。SF和SS刺激的MSC的這些旁分泌信號(hào)通過影響皮膚傷口微環(huán)境中多個(gè)常駐細(xì)胞的行為,有效地改善了皮膚修復(fù)和再生。與SS相比,SF在體外和體內(nèi)表現(xiàn)出更好的免疫調(diào)節(jié)作用,表明其作為MSC載體材料的皮膚再生潛力更大。據(jù)我們所知,這是第一項(xiàng)通過多組學(xué)分析提供細(xì)胞與SF和SS相互作用的全面、可靠見解的研究,這將直接有助于設(shè)計(jì)用于組織工程和干細(xì)胞治療的絲基支架。此外,我們的研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了“組學(xué)”技術(shù)在深入、高通量分子水平上評(píng)估細(xì)胞-生物材料相互作用的重要性和可行性,這可能對(duì)組織工程支架在材料選擇和腳手架設(shè)計(jì)方面的未來發(fā)展產(chǎn)生廣泛影響。
原文鏈接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adma.202210517
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