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cyf2277新蟲 (初入文壇)
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化學(xué)信息學(xué)案例:分子對(duì)接、聚類分析、藥效團(tuán)識(shí)別等
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【化學(xué)信息學(xué)】 化學(xué)信息學(xué)是建立在多學(xué)科基礎(chǔ)上的交叉學(xué)科,它運(yùn)用計(jì)算機(jī)技術(shù)、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法和化學(xué)知識(shí),用以解決藥物研發(fā)、材料設(shè)計(jì)、生物活性預(yù)測(cè)等方面的實(shí)際問題。我們熟悉的分子對(duì)接、QSAR、藥效團(tuán)識(shí)別等問題,都屬于化學(xué)信息學(xué)的范疇。在 AI for Science 時(shí)代,化學(xué)信息學(xué)軟件通過結(jié)合深度學(xué)習(xí)、機(jī)器學(xué)習(xí)等技術(shù),實(shí)現(xiàn)了許多前所未有的功能,提高了研究效率和成果質(zhì)量。 【Notebook案例】 化學(xué)信息學(xué)的學(xué)習(xí)并非易事。繁雜的教程資源四散各處,配置環(huán)境耗費(fèi)大量時(shí)間,難以隨著教程運(yùn)行和修改代碼,學(xué)習(xí)過程充滿挫折。 為了幫助大家學(xué)習(xí)和應(yīng)用化學(xué)信息學(xué),NBHub 為大家整理了一個(gè)豐富的化學(xué)信息學(xué) Notebook 系列,并將整個(gè)系列上傳至了 Notebook 案例廣場(chǎng)https://nb.bohrium.dp.tech! 通過案例的簡(jiǎn)單修改,就可以將化學(xué)信息學(xué)工具應(yīng)用于自己的應(yīng)用場(chǎng)景中,激發(fā)更多「化信」靈感。你可以在案例廣場(chǎng)通過搜索「化學(xué)信息學(xué)」來快速找到化學(xué)信息學(xué)系列 Notebooks。同時(shí),我們已為你預(yù)先配置好了所需的環(huán)境配置,使用我們?yōu)槟銣?zhǔn)備的在線 Notebook,你無需擔(dān)心環(huán)境配置和依賴問題,僅需要專注于學(xué)習(xí)本身。依靠 Bohrium 平臺(tái)免費(fèi)的 2 核 4G 計(jì)算資源,你可以在平臺(tái)上直接運(yùn)行和修改代碼。 在這里,我們?yōu)槟銕砹巳舾苫瘜W(xué)信息學(xué)案例,包括但不限于: 1. TeachOpenCADD 軟件系列案例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1277 2. RDkit軟件系列案例|以「使用 Uni-Mol 構(gòu)建 AI 模型的輸入」為例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1063 3. Psikit 軟件系列案例|以「二面角掃描」為例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1240 4. Datamol軟件系列案例|以「分子可視化」為例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1270 5. Jupyter_Dock 軟件系列案例|以「分子對(duì)接」為例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1234 6. ChemPy軟件系列案例|以「氯化鈉析出的多相化學(xué)平衡」為例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1269 |
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