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木棉和我木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
Materials Studio軟件GULP模塊dynamics中溫度和系統等設置問題 已有1人參與
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各位專家和同仁: 大家好!我在使用Materials Studio軟件GULP模塊dynamics進行氧化物熔體結構的分子動力學計算,F在遇到一個問題,即使用該模塊進行分子動力學計算時,每次計算只能設置一個固定溫度或系統嗎?如果可以設置溫度曲線(不同時間段溫度不同)或變化系綜(不同時間段系綜不同),怎樣設置?如果不能進行上述設置,是將上一步的結果作為下步計算的起始構型嗎?如何處理?預祝大家工作順心,成果多多!@smutao@oxox6085 |
木蟲 (職業(yè)作家)
新蟲 (初入文壇)
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我在一篇文獻上看到,好像用Gulp模塊設置然后運行,溫度機制就是跳躍機制,如果是分步機制和一步機制則需要對輸入gin文件進行修改 這是文獻中的文件修改示意圖:https://pan.baidu.com/s/1iPfLOIxIvmRA__nK3-tkSA?pwd=s5e9 圖中第3行由“temperature 6000K”修改為“temperature 6000 -0.15 20000 0” ,temperature 后面修改的參數代表意義為在 6000K 的初始溫度下 , 每步降溫 0.15K, 降溫 20000 步 , 在初始溫度下弛豫 0ps。 其他的我也不是很懂 |
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