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yexuqing木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
太陽系系主任
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增強子與啟動子相互作用繞過CTCF介導(dǎo)邊界
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增強子與啟動子相互作用繞過CTCF介導(dǎo)邊界 美國國立衛(wèi)生研究院的Pedro P. Rocha課題組發(fā)現(xiàn),增強子與啟動子的相互作用可以繞過CTCF介導(dǎo)的邊界,并有助于表型的穩(wěn)健性。相關(guān)論文1月30日在線發(fā)表于《自然-遺傳學(xué)》。 研究人員表示,增強子如何激活其遠端靶標(biāo)啟動子仍不完全清楚。 研究人員剖析了CTCF介導(dǎo)的環(huán)化如何促進和限制這種調(diào)控相互作用。通過利用小鼠突變體的一個等位基因系列,研究人員表明CTCF既不是Sox2基因與遠端增強子相互作用所需的,也不是其表達所需的。在Sox2及其遠端增強子之間插入CTCF基序的各種組合產(chǎn)生了具有不同絕緣程度的邊界,這與轉(zhuǎn)錄輸出的減少直接相關(guān)。然而,在外胚層和神經(jīng)組織中,增強子接觸和轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)都不能完全消除,并且插入也不能破壞著床和神經(jīng)發(fā)生。 相比之下,在攜帶最強邊界的突變體前部前腸中檢測不到Sox2的表達,這些動物在該組織中完全表型地丟失了Sox2。研究人員認為具有高密度調(diào)控活性的增強子簇可以更好地克服物理障礙,以保持忠實的基因表達和表型一致性。 相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41588-022-01295-6 |

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