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Quanma@ZJU新蟲 (初入文壇)
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[交流]
關(guān)于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)TSS的定義
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網(wǎng)上查到的大部分定義為：轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)是指與新生RNA鏈第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)DNA鏈上的堿基，通常為一個(gè)嘌呤（A或G） 也有說(shuō)是：轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)是指與新生RNA鏈第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)DNA模板鏈上的堿基 這里就出現(xiàn)了一個(gè)歧義，DNA有兩條鏈，一條模板鏈（反義鏈，與RNA互補(bǔ)配對(duì)），一條編碼鏈（正義鏈，與RNA序列相同），那么轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)指的是哪條鏈上與新生RNA對(duì)應(yīng)的堿基？ 根據(jù)我平時(shí)讀的文獻(xiàn)，新生RNA的5' end通常是一個(gè)G或者一個(gè)A，那么就意味著模板鏈對(duì)應(yīng)的那個(gè)堿基是一個(gè)C或一個(gè)T，那么事實(shí)上，轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)說(shuō)的是DNA編碼鏈上對(duì)應(yīng)的那個(gè)堿基，而不是模板鏈上對(duì)應(yīng)的堿基 也就是說(shuō)第一種說(shuō)法未明確的DNA鏈?zhǔn)聦?shí)上是編碼鏈，而第二種說(shuō)法是錯(cuò)誤的 有的文獻(xiàn)會(huì)把啟動(dòng)子TATA box和TSS畫在一起，據(jù)我所知TSS應(yīng)該是在模板鏈上？那么這時(shí)候TSS又在模板鏈上了（我個(gè)人認(rèn)為這種畫法有問(wèn)題） 不知道大家怎么看待這個(gè)問(wèn)題？ |
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