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[求助]
關于有參轉錄組比對率低的問題。求助 已有1人參與
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各位蟲友: 您好,F有一關于有參轉錄組比對率低的問題向大家請教! 本人所進行的試驗為自毒物質對植物根系進行脅迫,研究根系邊緣細胞(能夠遇水自動脫落的細胞)基因表達水平的變化。將樣品送公司以后達到了檢測合格標準,但數據回來時發(fā)現有兩個處理的三次重復比對率很低。其中CK和處理2(中濃度)的比對率在86%以上(這個屬于正常),而處理1(低濃度)的比對率分別為45%,60%和77%%,處理3(高濃度)的比對率分別為29%,39%和45%。 先想請教 問題一:這是什么原因造成的呢?給公司打電話咨詢也沒有給出肯定回答,只說有可能是脅迫影響的,但是處理2(中濃度)的比對率在86%以上,如果是脅迫原因造成,處理2的比對率也應該降低才對。 問題二:是否有蟲友經歷過此種情況呢?在寫論文的時候,如何解釋該問題? |
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