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| 【懸賞金幣】回答本帖問題，作者liyuy0921將贈送您 200 個金幣 | ||
liyuy0921木蟲 (正式寫手)
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[求助]
不做PCR試驗，從全基因組數(shù)據(jù)上挖掘序列構(gòu)建系統(tǒng)進化樹的方法？
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傳統(tǒng)方法常使用葉綠體上的 trnH-psbA、trnL-F、trnT-L、matK和ndhF等基因片段構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。而現(xiàn)在已經(jīng)有越來越多的植物葉綠體全基因組都公布了，那問題來了： 問題1：可以利用文獻中的引物，在現(xiàn)有的葉綠體全基因組上篩出trnH-psbA、trnL-F、trnT-L、matK和ndhF片段然后構(gòu)建系統(tǒng)進化樹嗎？不做傳統(tǒng)的PCR。 問題2：除了Blast外，有沒有相關(guān)的軟件可以快速的實現(xiàn)在基因組數(shù)據(jù)上用引物快速篩查某個片段？ 問題3：作為科研工作人員，你覺得這種方法可靠嗎？ |
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2樓2021-11-25 13:20:12
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