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大師兄文獻(xiàn)新蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
Cell | 震撼發(fā)布！迄今為止規(guī)模最大的小鼠蛋白互作組
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文獻(xiàn)來(lái)源：Skinnider, Michael A., et al. "An atlas of protein-protein interactions across mouse tissues." Cell 184.15 (2021): 4073-4089. PMID: 34214469 作者：頭禿的小師弟 導(dǎo)語(yǔ) 親愛(ài)的小伙伴們，今天的文章是一篇來(lái)自Cell主刊的文章，主題是關(guān)于蛋白-蛋白互作的檢測(cè)，這也是一個(gè)經(jīng)久不衰的話題了。現(xiàn)有方法的主要挑戰(zhàn)在于難以實(shí)現(xiàn)組織特異(tissue-specific)的大規(guī)模檢測(cè)。為此，本文改進(jìn)了先前發(fā)表的技術(shù)，實(shí)現(xiàn)了小鼠大規(guī)模蛋白互作的檢測(cè)。接下來(lái)廢話不多說(shuō)，快來(lái)看看本文到底說(shuō)了個(gè)啥 摘要 蛋白分子之間的動(dòng)態(tài)物理互作(physical interactions) 是細(xì)胞執(zhí)行生物學(xué)功能的基本方式。通常人們可通過(guò)高通量技術(shù)（如酵母雙雜交、蛋白質(zhì)微陣列等）構(gòu)建蛋白-蛋白互作圖譜。然而，現(xiàn)有技術(shù)很難捕捉動(dòng)態(tài)的互作過(guò)程。本文開(kāi)發(fā)了一種基于穩(wěn)定同位素標(biāo)記法和蛋白相關(guān)性檢測(cè)的蛋白互作預(yù)測(cè)方法(protein correlation profiling with stable isotope labeling of mammals, PCP-SILAM)。通過(guò)該技術(shù)，本研究測(cè)定了小鼠7種組織中共125000對(duì)蛋白互作對(duì)。通過(guò)比對(duì)不同組織的互作網(wǎng)絡(luò)，作者發(fā)現(xiàn)互作蛋白間重連(rewiring)現(xiàn)象十分頻繁，并且疾病相關(guān)蛋白趨于更頻繁地發(fā)生重連。本研究所開(kāi)發(fā)的技術(shù)可應(yīng)用于組織特異的蛋白互作組檢測(cè)，這使得從蛋白組大規(guī)模層面上研究器官組織對(duì)生理和病理刺激條件的響應(yīng)成為可能。 歡迎關(guān)注公眾號(hào)“大師兄的文獻(xiàn)筆記” 注：未經(jīng)許可禁止轉(zhuǎn)載！英文原文↓↓↓: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0092867421007042 |
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