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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 生物信息 » 轉錄因子及其下游靶基因
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轉錄因子及其下游靶基因 已有1人參與
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| 想問大家一個問題，A是轉錄因子，B是與其互作的下游靶基因。。那么，我想問，做A的過表達或沉默株系，B的表達量一定會發(fā)生變化的，是嗎？那么這種變化是如何的，A過表達，B表達量提高還是下降；A沉默，B表達量提高還是下降？我還想問，做B的過表達或沉默株系，A的表達量會發(fā)生變化嗎？ |
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yudaoqian88
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個人觀點，理論上，a表達變了，b應該也會變，但不是絕對的。首先，我們做體外驗證只是體外實驗，是有假陽性的，所以體內(nèi)真實的調(diào)控關系不能完全確定，所以我們不能據(jù)此下定論，即便我們用多個實驗證明它們之間的物理互作關系。其次，互作可能會牽涉其它輔因子，單獨調(diào)控一個，可能也會無濟于事。另外，功能冗余也是需要考慮的，所以敲除的方法可能沒有超表達效果好。當然，這是理論，具體情況還要根據(jù)實驗結果去驗證，去論證一個故事。至于調(diào)控前者對后者表達的影響，這完全取決于他們之間是激活還是抑制關系。最后一個問題，也不是絕對的，理論上不會反過來影響上游的表達，但有一個詞叫反饋調(diào)節(jié)，大概也提供了這種可能吧，也需要驗證。生命科學就是這樣的吧，說不清道不明的。靜待其他道友解答。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2021-02-23 00:08:09
游如海豚
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【答案】應助回帖
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想問大家一個問題，A是轉錄因子，B是與其互作的下游靶基因。。那么，我想問，做A的過表達或沉默株系，B的表達量一定會發(fā)生變化的，是嗎？那么這種變化是如何的，A過表達，B表達量提高還是下降；A沉默，B表達量提高還是下降？我還想問，做B的過表達或沉默株系，A的表達量會發(fā)生變化嗎？ 我復制下來回答你。A是轉錄因子，A促進B表達，如果B的表達量本身低。A過表達，一般情況B上調(diào)。A抑制B，如果B的表達量本身高。A過表達，一般情況B下調(diào)。如果B會反過來影響A，B改變，那么A從理論上來說也會變好，變好情況同上一致，如果B不能影響A，B變化，A不受影響。 |
3樓2021-02-25 13:46:08
游如海豚
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4樓2021-02-25 13:48:13
5樓2021-02-25 15:27:07
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