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興昌孫新蟲(chóng) (初入文壇)
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autodock打分第一的結(jié)合構(gòu)象數(shù)據(jù)怎么分析？
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每個(gè)縮寫(xiě)代表啥意思？ 圖中clRMS跟refRMS啥區(qū)別，哪個(gè)是平常所描述的RMSD？（還是說(shuō)都不是） 圖中結(jié)合能就是綜合靜電能、范德華力、疏水作用的打分函數(shù)么？ 有文章稱(chēng)，根據(jù)藥物跟蛋白合晶的xrd數(shù)據(jù)顯示，大多數(shù)小分子藥物與蛋白結(jié)合后張力能＜3kcal/mol。而部分打分高的化合物構(gòu)象忽略了分子內(nèi)能，這是其出現(xiàn)差異的一部分因素。這張力能在圖中能體現(xiàn)么？ 在這里我忽然想到，我能不能通過(guò)autodock某項(xiàng)操作，限制其構(gòu)象變化在一定的范圍內(nèi)，使其內(nèi)能變化在合理范圍內(nèi)——即低能。 QQ截圖20210214094926.png |
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新蟲(chóng) (初入文壇)
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2樓2022-10-17 20:24:38
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