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漫天飄雪

版主 (知名作家)

[交流] 計算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序

介紹
a post-processing code can calculate normalized trace of interatomic force constant tensors versus atomic distances from force_constants produced by phonopy. refer: nat. commun., 2014, 5, 3525.

具體公式
the interatomic force constant (ifc) tensor from first-principles calculation is

計算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-1

where e and rα represent energy and atomic position along α direction, respectively. by taking
trace of ifc tensors, we can assess bonding stiffness regardless of crystal structure or coordinate
system.

計算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-2

finally, we need to normalize the trace values of many materials to compare their interaction
ranges as in fig. 3, since different materials have slightly different bonding stiffness. the
normalization is done by the trace value of self-interaction force_constants.

計算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-3

###########
useage:
###########
1. chmod +x trace_ifc.x
2. phonon calculations with phonopy.
3. ./trace_ifc.x (it reads force_constants and sposcar produced by phonopy)
4. plot trace_ifc.dat with gunplot, python, or freemat and so on.
5. trace_ifc.dat 格式說明

計算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-4

計算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-5

[ Last edited by 漫天飄雪 on 2020-9-5 at 10:39 ]

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附件 1 : trace_ifc.zip

2020-09-02 17:12:35, 176.4 K

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raolixiang

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1樓 2020-09-02 17:20:13

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回帖置頂 ( 共有1個 )

漫天飄雪

版主 (知名作家)

漫天飄雪: 回帖置頂 2023-03-13 17:32:24

程序已經(jīng)集成到vaspkit里面了，可以通過命令vaspkit -task 738使用�。。。。。。。。�！

贊一下

回復此樓

16樓2023-03-13 17:31:14

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考拉VS博比

木蟲 (正式寫手)

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蟲號: 3923812

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厲害

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5樓2020-09-03 07:03:31

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raolixiang

新蟲 (正式寫手)

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謝謝你

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11樓2020-09-12 15:23:24

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raolixiang

新蟲 (正式寫手)

應助: 0 (幼兒園)
金幣: 509.5
帖子: 739
在線: 115.8小時
蟲號: 3721641

不太會分析，圖都做不出來，有高手指導一下嗎

贊一下

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12樓2020-09-12 20:18:11

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倔強的堅果墻

鐵桿木蟲 (正式寫手)

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劉老師就是霸氣！

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13樓2022-03-29 18:24:58

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逆流的船123

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14樓2022-09-27 13:41:04

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calos8182樓

2020-09-02 17:25 回復

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牛！

123dingyc3樓

2020-09-02 19:03 回復

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2020-09-02 20:05 回復

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2023-03-13 16:37 回復

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