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yyy0305至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點實驗驗證設(shè)計思路
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從現(xiàn)有的文獻(xiàn)資料數(shù)據(jù)庫得到的轉(zhuǎn)錄因子的核苷酸結(jié)合位點的motif，怎么設(shè)計一段核苷酸序列放在Minimal promoter前面驗證其啟動結(jié)合活性？ 我現(xiàn)在掌握的一些資料只允許我進(jìn)行模仿，但沒有獨立思考的能力，分享出來和大家討論下 我從Promega的官網(wǎng)上找到了NF-KB轉(zhuǎn)錄因子信號通路的設(shè)計，設(shè)計包括由一段轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點和一個Minimal promoter的連續(xù)核苷酸序列，后面接一個luciferase的基因，如下： GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC 兩個不同NF-KB motif的重復(fù)組合 AGATCTGGCCTCGGCGGCCAAGCTTAGACACTA 不知道這段的作用是什么？ GAGGGTATATAATGGAAGCTCGACTTCCAG Minimal promotor 請問一下在設(shè)計類似的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點時，一般設(shè)計的原則是什么？如轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的motif如何進(jìn)行重復(fù)和穿插設(shè)計，在結(jié)合位點和Minimal Promtor的核苷酸之間是否需要添加一段的核苷酸序列，這段序列的作用是什么？@biostar2009@wizardfan |
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3樓2021-05-04 20:51:50
2樓2020-07-28 13:34:54
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