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PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O5 ..O5 2.29 Ang. 已有1人參與
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PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O5 ..O5 . 2.29 Ang. 1/2-x,y,2-z = 3_557 Check PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O5 ..O6 . 2.32 Ang. 1/2-x,y,2-z = 3_557 Check PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O6 ..O6 . 2.41 Ang. 1/2-x,y,2-z = 3_557 Check 遇到A類錯(cuò)誤，DFIX 2.80 0.01 O5 O5 這個(gè)命令XL之后，進(jìn)行check。發(fā)現(xiàn)并沒有解決問題.... 求教�。�！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| 每個(gè)警告第二行有這個(gè)對稱碼（1/2-x,y,2-z），表明了其中一個(gè)原子如O5是最小不對稱單元中的，另外一個(gè)原子則是對稱出來的，你輸這個(gè)指令DFIX 2.80 0.01 O5 O5，自然是沒有效果，應(yīng)該加上對稱操作$1_1/2-x,y,2-z，然后DFIX 2.80 0.01 O5 O5_$1，若是Olex2解析的話，可以直接找到這兩個(gè)原子，選中加指令DFIX 2.80 0.01精修即可；另外還可以檢查O5與O6是否需要加氫，之間是否有氫鍵存在。 |
2樓2020-07-26 22:49:46
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3樓2020-10-18 20:27:00
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您好，我想請教這幾個(gè)B類錯(cuò)誤，望解答，謝謝 PLAT342_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.05444 Ang. PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D H15B ..H18B . 1.88 Ang. -x,2-y,1-z = 2_576 Check PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O17 --H17A . Please Check PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O17 --H17B . Please Check |
4樓2020-10-18 20:48:05
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