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Naomi2019新蟲 (初入文壇)
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[求助]
RNA-seq分析思路求指導(dǎo)
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我的RNA樣本為大腸桿菌瞬時(shí)轉(zhuǎn)染腺病毒的轉(zhuǎn)錄本。 分別為QC_OE、QC_KO、Aβ_OE、QC-Aβ_OE。 現(xiàn)在得到了華大基因測序的多組學(xué)系統(tǒng)的分析結(jié)果。 問題是,我想分析QC_OE之后顯著差異表達(dá)基因和pathway,所以開始嘗試用VENN圖來分析,但發(fā)現(xiàn)我知道選擇哪幾組進(jìn)行對(duì)比。我的理解是:比如WT vs QC↑ ∩ WT vs Aβ↑ ∩ WT vs QC-Aβ↑ ∩ Aβ↑ vs QC-Aβ↑代表 與QC↑有關(guān)的顯著差異基因。 我的思路是對(duì)的嗎?如果不對(duì),我應(yīng)該怎么分析呢?請(qǐng)大神指教。 @biostar2009 @wizardfan 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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