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Anthony07新蟲 (初入文壇)
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[求助]
【求助/交流】假單胞菌RED重組系統(tǒng)最后檢驗(yàn)PCR沒有條帶
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![]() 本人用RED重組系統(tǒng)敲除來(lái)敲除假單胞菌的某一基因,之前一直都能P出置換過(guò)的抗性條帶,自從疫情后,再次驗(yàn)證完全P不出條帶了。我重新開始制備,我的具體步驟是用pcm130擴(kuò)增出的抗四環(huán)素基因(上下游添加20bp的同源臂,之前是35bp,但是Tm值太大,縮減成20bp,之前也成功擴(kuò)出來(lái)了。),然后電轉(zhuǎn)化到帶有Pkd46的假單胞菌感受態(tài)(制備感受態(tài)前大搖用了L-阿拉伯糖誘導(dǎo)過(guò),制備感受態(tài)用的是10%的甘油多次離心,全程4度制備),10ul的目的片段+100ul的感受態(tài)混勻冰浴30min后電轉(zhuǎn),然后在加有氨芐和四環(huán)素的抗性LB平板上涂布(也加了L-阿拉伯糖)然后 隔夜培養(yǎng)也長(zhǎng)出了密密麻麻的單菌落,然后擴(kuò)大培養(yǎng)也能搖起來(lái),然后做菌液PCR擴(kuò)增四環(huán)素抗性條帶(也提過(guò)基因組DNA去P,cDNA也試過(guò)),試過(guò)多次,只有引物二聚體,很懵逼,不知道哪里出錯(cuò)了。有木有大神給點(diǎn)建議,該如何整。都能在雙抗性的平板上長(zhǎng)出單菌落,卻沒辦法P出條帶,然后拿這個(gè)菌也擴(kuò)增不出16s,有考慮過(guò)是不是真菌污染,擴(kuò)增過(guò)18s,沒條帶,確認(rèn)沒有污染。請(qǐng)求大神幫忙,感激不盡! |
新蟲 (初入文壇)
新蟲 (著名寫手)
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按理說(shuō)不應(yīng)該擴(kuò)增不出16 S,有沒有考慮過(guò)是PCR的問(wèn)題?找個(gè)實(shí)驗(yàn)室的其他人幫你做一遍,PCR的材料都用他自己的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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