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[求助]
請(qǐng)教基因調(diào)節(jié)問(wèn)題 已有1人參與
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我獲得一組X基因敲除表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)，找到某個(gè)差異性Y基因。但X基因肯定不是轉(zhuǎn)錄因子，lncrna和microrna，我想怎么研究x和y之間相互作用。因?yàn)閤不是轉(zhuǎn)錄因子和，lncrna和microrna，我認(rèn)為xy之間的相互作用，只能是間接作用。是否考慮敲除x基因后做rna-seq，或lncrna或microrna芯片，然后找出調(diào)節(jié)y基因的轉(zhuǎn)錄因子，lncrna或microrna。但x如何影響轉(zhuǎn)錄因子和lncrna microrna就不知道怎么辦了 |
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香園白丁
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4樓2020-04-13 23:24:44
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2樓2020-04-11 20:11:40
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| 感覺(jué)思路有些不太合適，X基因敲除后Y基因差異表達(dá)，（1）結(jié)果真實(shí)性問(wèn)題，是否存在脫靶（當(dāng)然相信已經(jīng)考慮過(guò)了）；（2）Y基因差異表達(dá)是蛋白水平還是轉(zhuǎn)錄水平呢？（3）X、Y基因的GO功能注釋，是否存在信號(hào)通路上下游的關(guān)系？（4）是否存在伴侶分子關(guān)系？（5）X、Y是否存在相互作用的可能客觀條件或者可能性？（6）還有轉(zhuǎn)錄因子和/或者轉(zhuǎn)錄因子活性怎么排除的？ |
3樓2020-04-13 17:23:51
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