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valennnnn新蟲 (初入文壇)
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260/280偏低直接做pcr可以嗎？ 已有2人參與
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用試劑盒提取的dna，幾個樣品測出來的濃度在50~80ng/μL這個區(qū)間，260/280都是1.5上下，感覺有蛋白污染。 如果只是用來直接用來p 16s問題大嗎？ 謝謝 |
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2樓2019-08-01 18:48:41
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16s擴增問題不大，DNA的情況還是要看樣本來源的。不同樣本來源，對OD260/280的要求，可以略有不同。況且，先擴增幾個試試條件看看擴增情況。若不行，再考慮純化。是做環(huán)境樣本擴增子高通量測序嗎？1.5的比值雖然低了點，但可以嘗試。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2019-08-01 20:43:01
5樓2019-08-01 20:55:50
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【答案】應(yīng)助回帖
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可以跑膠看一下，有條帶用27f/1492r擴增全長16s應(yīng)該問題不大，如果只擴其中幾個區(qū)域做mate16s應(yīng)該更容易 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
6樓2019-08-01 22:42:28
choujiaoqi
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7樓2019-08-02 09:02:49
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8樓2019-08-03 11:28:40
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