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一棵安靜的樹金蟲 (小有名氣)
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[求助]
BLAST中關于字長WORD SIZE的設定問題!
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生物信息學中,BLAST章節(jié)里,關于字長的設定里,是這么描述的:WORD SIZE:所謂字長是指用作比對起始種子的序列長度。將查詢序列分割成一系列特定長度的小的序列段(字段)或(搜索窗口)。 默認值:核酸為11,氨基酸為3。 蛋白質:字段增大,搜索精度提高; 核酸:字段降低,搜索更準確,速度更慢。 為什么蛋白質是字段增大,精度增加,而核酸是字段降低,精度增加。問了幾個人,大家對于這里的理解都不一樣。所以發(fā)帖請教。 請蟲友們不吝賜教! |
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