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本人在學(xué)習(xí)基因敲除的相關(guān)知識(shí)，看到論文中提到了同源臂，請(qǐng)問(wèn)同源臂是根據(jù)什么序列設(shè)計(jì)引物來(lái)合成的，舉個(gè)例子，待敲除基因?yàn)?b>ATGCTTACCATGCCGGACGTCATCGTCAAAAATCAGAGCGAGCTTGATGC·············TACCGCATGGAATTGTTGCACCACGTCTGA，是根據(jù)粗體部分設(shè)計(jì)引物還是需要知道待敲除基因兩側(cè)的序列才能設(shè)計(jì)

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1樓 2019-02-09 15:21:35

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Eternity宇

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西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖交流 2019-02-13 20:30:09

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2樓2019-02-09 16:29:42

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2樓: Originally posted by Eternity宇 at 2019-02-09 16:29:42
很多，比如Takara的In-fusion酶界面上就有在線的設(shè)計(jì)工具

謝謝您的回復(fù)，請(qǐng)問(wèn)同源臂在靶基因前后之外的區(qū)域嗎

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3樓2019-02-09 19:14:32

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Eternity宇

禁蟲 (著名寫手)

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4樓2019-02-09 22:23:00

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4樓: Originally posted by Eternity宇 at 2019-02-09 22:23:00
其實(shí)就是兩側(cè)的序列
...

也就是說(shuō)同源臂并不是待敲除基因的一部分，而是其前側(cè)和后側(cè)的一段對(duì)嗎？我看了一篇中文文獻(xiàn)，在這個(gè)截圖里ATG和TAA是待敲除基因的起始密碼子和終止密碼子，而劃線部分是同源臂，這是為什么呢，同源臂的設(shè)計(jì)到底能不能和待敲除基因重疊呢？

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5樓2019-02-10 12:25:18

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4樓: Originally posted by Eternity宇 at 2019-02-09 22:23:00
其實(shí)就是兩側(cè)的序列
...

抱歉，我不知道怎么插入圖片了

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6樓2019-02-10 12:27:13

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西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖交流 2019-02-13 20:30:33

我們一般都是起始密碼子上游60bp，終止密碼子下游60bp，不含密碼子

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7樓2019-02-12 16:15:00

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7樓: Originally posted by lizimu566 at 2019-02-12 16:15:00
我們一般都是起始密碼子上游60bp，終止密碼子下游60bp，不含密碼子

這么短嗎？你們是不是敲大腸桿菌的某個(gè)基因，我看到有些文獻(xiàn)的同源臂有500-600bp（非大腸桿菌），我的目的菌株不是大腸桿菌，準(zhǔn)備用Red同源重組

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8樓2019-03-04 21:46:47

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8樓: Originally posted by Cherishqj at 2019-03-04 21:46:47
這么短嗎？你們是不是敲大腸桿菌的某個(gè)基因，我看到有些文獻(xiàn)的同源臂有500-600bp（非大腸桿菌），我的目的菌株不是大腸桿菌，準(zhǔn)備用Red同源重組...

我們是大腸桿菌

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9樓2019-03-05 08:51:49

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