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zht930528木蟲 (正式寫手)
麻辣王子
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[求助]
想做一個KEGG pathway的氣泡圖，某pathway的總基因數(shù)怎么找呢？
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如題。 比如顯著差異基因有90個，其中KEGG富集分析有8個參與A pathway， 在這個物種中有1萬個基因，在這1萬個基因里邊總共有多少個gene參與A pathway呢？ 可以怎么查找或解決？ |
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笨方法：TCApathway中對應(yīng)的ko，在看ko對應(yīng)的基因。如果有對應(yīng)的關(guān)系列表更好解決。如果不急需的話，可私聊留一個郵箱 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2019-01-02 20:04:56
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如果是常見的物種，可以直接查詢該物種對應(yīng)的pathway，或者可以查詢該pathway下所有基因，再挑出該物種的基因 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
zht9305282樓2019-01-02 11:42:43
zht930528
木蟲 (正式寫手)
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3樓2019-01-02 11:44:48
zht930528
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5樓2019-01-02 20:48:43
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