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valennnnn新蟲 (初入文壇)
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[求助]
260/280偏低直接做pcr可以嗎? 已有2人參與
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用試劑盒提取的dna,幾個樣品測出來的濃度在50~80ng/μL這個區(qū)間,260/280都是1.5上下,感覺有蛋白污染。 如果只是用來直接用來p 16s問題大嗎? 謝謝 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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可以跑膠看一下,有條帶用27f/1492r擴增全長16s應(yīng)該問題不大,如果只擴其中幾個區(qū)域做mate16s應(yīng)該更容易 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

鐵桿木蟲 (知名作家)
新蟲 (初入文壇)
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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16s擴增問題不大,DNA的情況還是要看樣本來源的。不同樣本來源,對OD260/280的要求,可以略有不同。況且,先擴增幾個試試條件看看擴增情況。若不行,再考慮純化。是做環(huán)境樣本擴增子高通量測序嗎?1.5的比值雖然低了點,但可以嘗試。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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