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supergrape金蟲(chóng) (小有名氣)
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關(guān)于使用自殺質(zhì)粒pK18SacB進(jìn)行敲除受體菌基因組上的相關(guān)片段 已有2人參與
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| RT,我在前期將pK18SacB進(jìn)行改造,把卡那霉素基因替換為氯霉素(受體菌帶有卡那霉素抗性),左右同源臂的長(zhǎng)度大小是在500bp左右,構(gòu)建好的自殺載體pK18SacB是利用大腸桿菌S17進(jìn)行接合轉(zhuǎn)移,將濾膜上的菌體洗脫后涂到含有卡那霉素和氯霉素的培養(yǎng)基上。雙抗板上確實(shí)長(zhǎng)出疑似單交換的菌株(受體菌是假單胞菌,菌落形態(tài)與大腸桿菌不一樣,很容易分辨),同時(shí)涂到雙抗板上的受體菌沒(méi)有長(zhǎng)。問(wèn)題是,當(dāng)我用左同源臂的上游引物+右同源臂的下游引物進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證,結(jié)果只有一左同源臂+右同源臂的目的條帶,沒(méi)有左同源臂+敲除片段+右同源臂的目的條帶(PCR延伸時(shí)間是按照左同源臂+敲除片段+右同源臂的長(zhǎng)度進(jìn)行設(shè)置的)。隨后,我設(shè)計(jì)了基因組上左同源臂的上游引物+自殺質(zhì)粒中右同源臂下游引物進(jìn)行pcr,結(jié)果沒(méi)有相關(guān)目的條帶(PCR延伸時(shí)間是按照左同源臂+敲除片段+右同源臂+300 bp的長(zhǎng)度進(jìn)行設(shè)置的)。懇請(qǐng)大佬解釋一下,雙抗板上的菌株是單交換的菌株嗎? |
| 左同源臂的上游引物+右同源臂的下游引物 PCR 產(chǎn)物送測(cè)序,如果是你設(shè)計(jì)的同源臂,那應(yīng)該是成功的 |
金蟲(chóng) (小有名氣)
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