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大家好，我使用autodock vina進(jìn)行分子對(duì)接，隨后使用pymol進(jìn)行可視化處理，發(fā)現(xiàn)兩個(gè)軟件顯示的氫鍵數(shù)量有所不同，pymol會(huì)多上1-2個(gè)氫鍵，請(qǐng)問(wèn)這是什么原因呢？

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1樓 2021-08-04 10:29:24

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2樓2021-08-04 10:51:08

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2樓: Originally posted by hupojy33 at 2021-08-04 10:51:08
兩個(gè)軟件判斷氫鍵的標(biāo)準(zhǔn)不一樣，你可以看一下，多出來(lái)氫鍵是否真的存在

十分感謝您的回復(fù)，請(qǐng)問(wèn)我在pymol上如何判斷是否真的為氫鍵呢？以下是我pymol處理的對(duì)接圖，還請(qǐng)您指教！

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3樓2021-08-04 12:51:19

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2樓: Originally posted by hupojy33 at 2021-08-04 10:51:08
兩個(gè)軟件判斷氫鍵的標(biāo)準(zhǔn)不一樣，你可以看一下，多出來(lái)氫鍵是否真的存在

抱歉，圖片好像發(fā)不出來(lái)，您可以指教一下判斷方法嗎？

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4樓2021-08-04 12:53:58

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6樓2021-10-01 09:43:13

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7樓2021-11-17 15:41:16

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樓主，您的問(wèn)題解決了嗎我的是pymol少氫鍵

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8樓2023-07-03 08:15:24

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